梵蒂岡再度重申，梵蒂岡打算就主教任命協議與中國繼續進行對話，並且辯護說，2018年與中國政府簽訂的這個協議對中國天主教會的信仰生活是必須的。美國強烈反對這項協議。
梵蒂岡教廷國務卿帕羅林樞機主教（Cardinal Peitro Parolin) 星期六（10月3日）在紀念義大利傳教士抵達中國傳教150週年的演講中，針對續簽梵中主教任命協議所引發的批評，作出了教廷最權威也是最全面的回應。
帕羅林樞機主教強調，梵蒂岡對中國的對話策略是一脈相承的。他說，在中國共產黨掌權，驅逐外國傳教士之後，教宗庇護十二世（ 任期：1939-1958）就試圖重啟與北京對話的路線；榮休教宗本篤16世在任內批准了梵中主教任命協議草案，現任教宗方濟各最終於2018年簽訂這個協議。
美聯社星期天（10月4日）報導說，帕羅林表示榮休教宗本篤16世在位時就已經批准梵中主教任命協議草案具有深意，目的是要讓批評教宗方濟各的保守派人士噤聲。很多這些批評者對教宗本篤16世的保守作風念念不忘，而且用梵中協議來削弱教宗方濟各的聲望。
有批評說，教宗方濟各2018年與中國簽署的主教任命協議草案出賣了中國的地下教會信徒。梵蒂岡則辯護說這個協議是必要的，是為了避免在中國沒有經過教宗同意下任命主教，從而導致中國教會分裂更加惡化。
教廷國務卿帕羅林樞機主教星期六（3日）在演講中說，這個協議只是關於主教任命，完全沒有觸及中國教會生活的其他層面，沒有涉及政治議題。他說，這項協議值得續簽，因為為期兩年的協議太短了，很難評估其價值。
梵中續簽主教任命協議的議題也導致美國與梵蒂岡關係緊張。美國國務卿龐畢歐曾發文，對梵蒂岡與中國即將續簽這項協議表達不滿，稱梵蒂岡如果續簽，將會「危其自身的道德權威」。帕羅林樞機主教稱，教宗方濟各對這篇文章感到「驚訝」，梵蒂岡與其把這篇文章理解成一種外交姿態，不如說是一種蓄意的冒犯。
隨後，梵蒂岡9月30日正式拒絕龐畢歐與教宗方濟各的會面請求。理由是教宗方濟各不會在美國大選前接待任何政治人物。梵蒂岡還回絕了龐畢歐試圖阻止梵蒂岡與中國達成續簽協議的努力。
但是龐畢歐10月1日抵達梵蒂岡訪問後，與帕羅林樞機主教以及梵蒂岡外長保羅・加拉格爾（Paul Gallagher）大主教舉行了45分鐘的會談，龐畢歐在會談中談到中國的宗教自由問題。
龐畢歐9月30日在羅馬的一次宗教自由會議上演講時說，在侵犯宗教自由問題上，地球上沒有其他任何地方比中國更嚴重，他呼籲梵蒂岡與美國一起譴責中共侵犯宗教自由的行為，他說，天主教應當站在鬥爭的前列，保護基本人權。
長期以來，對中國主教的任命權困擾著梵中關係。羅馬教廷堅持教宗有任命使徒接替人選的神聖權利；北京則認為教廷任命主教是外國對中國主權的侵犯。
2018年9月梵中主教協議草案簽訂，教宗方濟各認可7名由中國官方任命的主教，這是梵中關係歷史性破冰，但是反對聲音不斷。香港榮休樞機主教陳日君以「送羊入虎口」批評說，任何與北京當局的協議都是對天主教的背叛。
天主教內部對此協議持反對意見者也擔心，梵蒂岡把更多的控制權交給北京，可能使中方更加嚴厲打壓宗教。
70多年來中國的天主教徒除了隸屬於官方認可的天主教愛國教會以外，還有數以百萬計的忠於羅馬天主教廷的地下教會教徒，他們不承認中國天主教愛國會和中國天主教主教團。 （相關報導： 教宗怕觸怒北京，拒見美國務卿？龐畢歐訪呼籲方濟各：鼓起勇氣，對中國硬起來！ ｜ 更多文章 ）
香港星島日報星期天（4日）報導說，天主教香港教區主教職位已經空懸21個月， 88歲高齡的陳日君樞機主教早前到梵蒂岡，希望有機會獲得教宗方濟各接見或通電話，討論香港主教接班人問題，但沒有獲得教宗接見。報導說，陳日君表示，如果教廷任命親中的香港主教，他選擇死後不葬在主教座堂，而是跟天主虔誠的子民一同安葬在淳樸的墓園。
