為了阻止首都圈的第三波疫情繼續擴散，日本政府最早將在7日宣布「緊急事態宣言」，首都圈的東京都、神奈川縣、千葉縣、埼玉縣（一都三縣）都將進入為期一個月的「緊急事態」。不過這次菅義偉似乎打算縮小限制範圍，主要針對餐飲業限制營業時間，學校與幼稚園、托嬰中心可能也將維持正常運作。不過日本政府也同步提出修法，在法源中增加罰則的規定。
菅義偉4日曾召開記者會，針對一都三縣的疫情不斷惡化，表示政府正在評估再次宣布「緊急事態宣言」的必要性，而且這次可能會將學校與電影院排除在外，盡量縮小受到影響的範圍，強調要以「集中、限定」的方式來進行。日本媒體5日引述知情人士說法，表示最快將在7日正式宣佈「緊急事態」，並且會將持續時間限制在1個月左右。
雖然是否宣布「緊急事態宣言」是首相的權限，不過根據《每日新聞》報導，菅義偉政府還是會先聽取專家諮詢委員會的意見，並且向國會做出發布「緊急事態」的說明後，才會正式實施，這也算是回應東京都知事小池百合子等首都圈的地方首長日前的緊急呼籲。菅義偉4日也在富士電視台表示，針對進入「緊急事態」的區域，可能會要求民眾在晚間8時之後「外出自肅」（自我控管非必要外出），「基本上不考慮全面停課」、「大學入學測驗也不受影響」。
針對「緊急事態宣言」的法源《新型流感對策特別措施法》，菅義偉也打算進行（管制營業時間的）給付金與罰則的修正，將在1月18日召開的會期提出草案，預計2月上旬將可過關。《每日新聞》分析，菅義偉依然堅持延期到今年舉行的東京奧運要如期登場，因此除了增加處罰的規定之外，他也宣布只要傳出變種新冠病毒感染的國家，日本就即刻停止雙方的短期商務旅行。《日本經濟新聞》稱，如果菅義偉發布「緊急事態」，日本很可能擴大邊境防疫措施，甚至有可能全面停止外國人入境。
日本上次因為新冠疫情發布「緊急事態宣言」是在去年4月7日到5月25日，一開始僅有東京等7個都府縣實施，很快就擴及全國。首相宣告進入疫情危急的「緊急事態」後，知事可以要求民眾「外出自肅」、限制使用特定設施、限制音樂會等群聚活動、也可為了開設臨時醫療設施緊急徵用土地或建物。不過相較於上次的全面停課與大規模限制群聚活動，菅義偉政府似乎無意影響學校教育，限制營業的對象也將以餐飲業為主。
雖然菅義偉強調，這次的「緊急事態宣言」會與去年的「非常不同」，強調將會縮小影響範圍，但矛頭所指的餐飲業卻是叫苦連天。《每日新聞》指出，東京的餐飲業者因為這波疫情受到很大衝擊，對於即將到來的「緊急事態」更是叫苦連天。新宿歌舞伎町的酒吧業者表示，「開業10年從來沒有這麼慘過，未來已經不知道要怎麼辦了」。對於政府提供的「協力金」，他也說完全無法填補赤字。 （相關報導： 頂級相撲力士染疫第一人：第69代橫綱白鵬確診！同一相撲部屋力士緊急篩檢新冠 ｜ 更多文章 ）
雖然東京都政府早就呼籲店家晚上10時打烊，歌舞伎町仍有許多店家營業到深夜。在當地一間燒烤店工作的女性員工就說，大家都要生活付帳單，根本不可能那麼早打烊，「如果國家或者是東京都政府願意補差額給我，我當然願意休假」。橫濱中華街的廣東料理店「桂宮」老闆梁偉結也說，配合縮短營業時間每天只能拿到4萬日幣（約合新台幣1萬1千元），這個數目「完全不夠（補貼損失）」。事實上首都圈一都三縣已經決定，從1月12日起將提前打烊的要求擴及所有餐廳（原來僅限於提供酒類的餐廳）。
