台灣大學校長遴選案爭議尚未平息，教育部長潘文忠今（6）日在施政總質詢表示，台大是學術龍頭，其校長是引領學術發展的關鍵領導者，台大自身校長遴選作業細則亦要求，校長須具備高尚品質以及學術成就。因此，教育部對於管中閔當選人來自監察院以及社會爭議，將審慎處理，強調不是刻意因特定人選問題。
台大校長當選人管中閔日前因涉及學術倫理、未利益迴避被質疑資格有疑義，然台大至今已開學一周，教育部仍未核定新任校長，被外界質疑是「卡管」，引發討論。時代力量立委洪慈庸指出，有人欲將此操作成「藍綠鬥爭」，有意打擊政府威信，盼行政院可挺教育部「依法行政。」
行政院長賴清德則回應，基本上，教育部的處理精神就是「依法行政」、「公開處理」；潘文忠則表示，過去2年台大因為學術倫理問題，影響其學術形象、聲望，當時立法院不分朝野，要求教育部痛定思痛，嚴查、嚴辦學術倫理事項。
潘文忠說，針對台大遴選的聘任，教育部秉持尊重大學自治、依法行政原則，對於來自向監察院、社會爭議，有責任釐清，待遴選資格釐清後，才會完成聘任程序，這是教育部在面對國立大學校長遴選的一致的立場及作法。而管中閔是否涉及違反學術倫理、未有利益迴避等，確實與遴選資格有密切相關。
「論文議題須回歸學校」 潘文忠：台大擬開臨時校務會議釐清
至於目前處理進度，潘文忠表示，教育部正審視由台大遴選會所提供之資訊，亦在2月26日召開學術審議工作會議，由於大家眾說紛紜，當時共識是論文是否涉及學倫問題，必須「回歸學校」或由「學術同儕認定」。
潘文忠進一步指出，根據台大校長遴選細則，校務會議具有推薦、同意的權限，須有3分之1代表通過後，始可成為校長遴選候選人，也因此前提，目前台大校務會議代表已達法定連署門檻，要求校方召開「臨時校務會議」，以釐清疑義。 （相關報導： 管中閔任命案 台大近期學辦臨時校務會議程序委員會 ｜ 更多文章 ）
潘文忠強調，教育部本於尊重學術自治原則，以及校務會議代表亦有提出遴選爭議，教育部希望台大儘速依照校規，召開臨時校務會議釐清疑義，這是自治重要事項，而教育部將會依法儘速處理，盼讓爭議告一段落，以利台大校務運作可穩健發展。
