國軍建案問題層出不窮，今年爆出「愛國者三型飛彈重鑑測」案，更讓國防部長嚴德發大怒，認定是重大作業疏失，將研議軍投建案流程改為四階段。國防部也將中科院重新定位為「廠商」，淡化中科院主導建案的角色。
軍方檢討發現，先前因建案簡併為兩階段，導致延伸案作業維持計畫無人審查，衍生出「巧門」。嚴德發這次終於「凍未條」，下令嚴肅作業流程與紀律，將軍事投資建案改為四階段，2021年1月起立馬上路。軍方高層強調，新規定並未更改現行制度的精神與內涵，但會更加緊密鏈結計畫與作戰階層。
軍方雖稱新制沒有太大變化，但建案改採4階段後，至少會出現時程、5年兵力整建計畫把關、納入後勤體系、中科院角色淡化等4大變化。
第一個改變是時程。原本兩階段最快於半年即可走完流程，軍方坦言，未來勢必回到從前，所需時間至少與過去3階段相同，由1年半起跳。其次，以5年兵力整建計畫嚴格把關。大鵬時代讓流程抄捷徑，導致後來建案跳脫、插隊等狀況不少。為防堵亂象，未來只要未列5年兵力整建計畫的案子就免談，不再受理。
