蔡政府上任後力推國防自主，包括國機國造、國艦國造等政策均陸續展開作業。不過有媒體報導，指出「潛艦國造」才剛開始推動，卻已經出現包括美國軍火商、我國軍方內部、立法院等不同單位相互角力，還因此遭立法院凍結一億元預算，混亂局面引發外界憂心，認為才剛開始就如此，前景堪慮。海軍司令部對此回應表示，潛艦是我國「不對稱戰力」的關鍵，歷經多年後，如今終能逐具雛形，將依期程落實造艦規劃。
海軍司令部指出，107年立法院凍結1億元，針對本案，會持續與立法院國防外交委員溝通說明，並將配合10月份立院會期申請解凍事宜，海軍完全尊重委員職權，亦請各委員支持。
另外，海軍司令部指出，潛艦國造是國防自主的重大政策，潛艦更是捍衛國家安全可恃的「不對稱戰力」。在歷經十餘年潛艦籌獲未能如願後，到今天能夠突破困局且已略具雛形，海軍將依期程與風險管理落實執行造艦規劃。
防掮客與代理商介入 學者中科院共同管控
海軍司令部表示，為確保第一艘潛艦的原型艦能順利完成建造及品質，均由主合約廠商台船公司與原廠直接接觸，避免掮客與代理商介入，各項商源均由潛艦人員、中科院及國內學者，專案共同審查與管控，均依法行政，以杜絕任何違法弊端的發生。
海軍司令部強調，本案目前進度正常，均依各項工作節點推進，針對各項商源，均依規格審慎審查，符合條件者納入優先等級，完全由主合約商台船公司議約、議價，本軍不參與任何開標與議價，負責專案管理與履約督導，避免有任何不當意圖謀利，確保本案依法、依約執行。
