近年來台灣蝙蝠的數量銳減，從2005年的50萬隻，銳減到2014年的20萬隻，但原因始終成謎。台灣師範大學生命科學系教授吳忠信團隊花了3至4年時間，用各種方法進行田野調查，發現原因是蝙蝠體內殘留大量農藥及重金屬，因此破壞了中樞神經及回聲定位系統。
台灣師範大學生命科學系教授吳忠信表示，蝙蝠對於農業有極大的助益，例如幫助植物傳粉，以及防治植物病蟲害等，可以說是免費的「天然殺蟲劑」。他花了將近4年的時間，透過田野調查，採集北中南東不同地區的蝙蝠糞便，發現不同地區的蝙蝠體內竟留有不同種的重金屬與農藥，破壞其身體機制，導致迷航蝙蝠無法正常捕捉昆蟲，大量消失在田野中。
吳忠信投入台灣蝙蝠回聲定位研究長達20年，這次選擇和國內藥廠合作，到全台蒐集並化驗蝙蝠的糞便，他發現北部在翡翠水庫、北海岸一帶的蝙蝠糞便含有超量鉛、汞、鉻等重金屬，主要來自工業與交通排廢氣的汙染；中、南部糖廠一帶，則發現蝙蝠的糞便中含有超量的砷、銅等重金屬，為農業汙染所致；東部蝙蝠則測出錳重金屬超量。
推動有機農業 蝙蝠能助減少蟲害
吳忠信說明，這些汙染物存在在蝙蝠的體內，破壞蝙蝠的中樞神經以及回聲定位系統，嚴重時蝙蝠甚至無法正常飛翔，一旦無法在空中正常捕捉昆蟲或是躲避障礙物，許多蝙蝠種類就會逐漸喪失生存本能，漸漸消失。他表示，推動有機農業是重要關鍵，蝙蝠也能夠替代人工方式減少蟲害，一舉兩得。 （相關報導： 胡一天專欄：區塊鏈與蝙蝠通訊系統 ｜ 更多文章 ）
吳忠信指出，世界上有100多種果樹都有賴蝙蝠播種及傳播花粉，並舉例說明東南亞榴槤都是靠蝙蝠授粉，如果沒了蝙蝠，榴槤也會跟著消失。
