反同志教育公投在即，中選會才提出反擊？11日中選會發布公投公報，附上行政院意見書，對於下一代幸福聯盟所提「愛家公投」反對同志教育第11案，政院強調「若無同志教育的實施，即難以有效預防校園性霸凌事件」、「廢止同志教育無助提升學生性平意識」等，隱含對第11案的不認同。只是過程中，反同婚與反同志教育公投案的傷害已然造成，有平權團體志工便私下透露，這些公投案「反對這群人存在的本質，反對這些人在社會上生活的本質」，投的每一票、宣傳過程的每句話，對LGBT族群都是傷害。
中選會於公投公報附上的政院意見書首先指出，《性別平等教育法》的目標在於促進對不同性別與性向之瞭解與尊重對待，達成無偏見歧視的性別友善教育環境、預防校園性霸凌事件等，而政府本應依法依適宜年齡實施同志教育，若公投通過，政府會尊重結果，在符合《憲法》平等權保障前提下以「合宜方式」進行性平教育。
而何謂《憲法》平等權保障，政院引述大法官釋字748解釋理由書：「在我國，同性性傾向者過去因未能見容於社會傳統及習俗，致長期受禁錮於暗櫃內，受有各種事實上或法律上之排斥或歧視；又同性性傾向者因人口結構因素，為社會上孤立隔絕之少數，並因受刻板印象之影響。」破除刻板印象，便是保障平等權的工作之一。
行政院：性平教育「不可切割的一部份」
對於第11案提案理由之一「同志教育極易將原本經過諮商輔導以後會進入兩性『自然互動』的學生，導引至『同性結合』的關係，影響兒少身心發展甚鉅」，政院強調，是對同志教育的誤解，也隱涵對同性性傾向的歧視與刻版印象。
對於第11案理由書「吹捧同志形象為時髦風尚的政策立場」一語，政院也強調是對同志教育有誤解，實際上同志教育是讓學生了解並尊重不同性別特質、性別認同與性傾向，原本就是屬於性別平等教育「不可切割的一部份」。政院也強調，由性霸凌立法定義（透過語言、肢體或其他暴力，對於他人之性別特徵、性別特質、性傾向或性別認同進行貶抑、攻擊或威脅之行為），可見若無同志教育的實施，即難以有效預防校園性霸凌事件。
政院強調，現行國中小教科書均依「國民中小學九年一貫課程綱要」進行編纂，向教育部申請審定，而課綱在研修過程中早已將第11案強調的「適齡」納入其中；若第11案只是對同志教育部份教材、教學方法有疑慮，已經可由國家教育研究院相關規定與機制進行討論與處理，若是要在國民教育階段廢止「同志教育」，難以達成性別平等教育法之立法精神與目的，也無助於提升學生之性平意識。
