《賽德克巴萊》的電影從2011年上映至今依然有眾多討論，也深深影響我們對霧社事件的看法，在1936（昭和11）年由南方土俗發行所出版的文章：〈莫那魯道的最後〉，敘述了莫那魯道奮勇抗戰，最後選擇自殺前的一幕：
……家族十六人在穀倉內集體上吊自殺後，莫那魯道殺害妻子以及孫子之後，之後，在如雲海一般的森林深處，一處無人知曉的地方消失，接著聽到森林中有一聲槍響，他用三八式步槍自盡……
這就是莫那魯道的最後了……是嗎？大家有沒有想過，莫那魯道的遺骨在那之後會被怎樣對待呢？
靈魂踏上彩虹橋，但遺骨還未回故鄉
針對這個問題，疑案辦的調查員仔細一想，就想起南投仁愛鄉霧社不是還有一處霧社事件紀念公園，以及莫那魯道之墓嗎？從莫那魯道自殺，再到下葬墓園，這中間難道是敵人日本人特別安置的嗎？ 不可能，要知道當時日本方面，連臺灣總督都因霧社事件而引咎辭職，而且雙方都損失慘重，日本政府更將霧社事件當作一場「動亂」來處理，那被認為是「動亂首領」的莫那魯道，其屍體自然就不會受到隆重的紀念與下葬了。
而這個莫那魯道之墓，其實一直要到中華民國政府的1973年才成立，從1930（昭和5）年的霧社事件算起，隔了43年莫那魯道的屍骨才被安置，那問題來了，將近半世紀，莫那魯道的屍骨下葬前，到底在哪裡？ 根據吳俊瑩的研究，這副骨骸，其實一直躺在台大人類學系。目光切到1973年，臺北臺灣大學，當時臺大考古人類學系（今臺灣大學人類學系）的代主任李亦園在校內寫信給校長寫道：
……本系同仁以為此一烈士之骨骸不宜收藏於研究機構，實應歸葬於其故鄉，建立墓園，以供後人瞻仰。……
這一烈士骨骸，其實就是莫那魯道之骨！原來，莫那魯道死後骨骸的旅程，竟然有一站來到了學術機構內，從南投來到了臺北，從祖靈之鄉來到了繁華都市。而這趟旅程，長達43年之久，又令人覺得驚訝與哀傷，這中間發生了甚麼事情呢？
殖民統治對反抗者的極致利用
這一切要先從霧社結束事件後的1933（昭和8）年說起，一位賽德克人在打獵途中在馬赫坡溪的洞窟內發現一把三八式步槍，以及一副骨骸，骨骸幾已成白骨，但一腳的骨骸上仍有表皮附著，有木乃伊化的現象。身上遺物有公醫帽、銀腕環、蕃刀，與蕃人用的煙管。 報案後而來的警方，也藉此推定應該就是莫那魯道的骸骨，一番調查後，警方將遺骨移往川中島部落，該部落是霧社事件後活下來的「反抗蕃」被強迫集體居住之處，也是莫那魯道女兒──馬紅莫那的居住處。經過馬紅莫娜指認後，確認該骨骸是莫那魯道本人。接著，骨骸與遺物再被交給上層機關能高郡所保管。
