2016總統大選在國民黨、民進黨、親民黨等3組正副總統參選人分別完成登記後，國安局特勤中心依法正式接手人身保護等各項維安任務，國安局亦援例規劃在12月14日總統、副總統選舉候選人抽籤決定號次前，分別安排各組候選人到國安局局本部，聽取「當前國家安全情勢分析」簡報，做為候選人擬定各項政策與政見的參考。
3組候選人同版本簡報 供擬定政見參考
國安局官員表示，國安局自2000年總統大選開始，比照美國中央情報局做法，在各組正副總統候選人完成登記後，除提供人身保護的維安任務外，也安排候選人到國安局聽取同一個版本的「當前國家安全情勢分析」簡報，內容是提供各組候選人瞭解未來5年國際情勢、大陸情勢及台灣地區安全情勢發展，這次的簡報內容就涵蓋中國一帶一路的經濟合作戰略、南海、反恐等的議題，並分析未來可能發展與我方可能面臨的安全風險，做為候選人擬定各項政策與政見的參考。
維安要求 正副總統候選人不搭同車
至於候選人的維安任務，該名官員表示，因時間緊迫，這次各政黨總統參選人一宣布副手人選後，特勤中心隔天就向正副總統參選人簡報有關選舉期間維安部署工作，以及希望正副總統參選人能配合，選舉期間兩人不共乘一輛車或同一種交通工具，戶外掃街造勢儘量不要燃放鞭炮，與搭乘國安局提供的防彈掃街車，並身著防彈衣；若參加立委造勢掃街活動，搭乘立委提供的車輛時，車輛的駕駛一定要由特勤人員擔任，才能把危安因素降到最低。
副手宣布太晚 影響進駐住家維安
但是2016總統大選與過去總統大選最大不同處，就是各政黨都在11月16日以後宣布副總統參選人，距離登記不到10天，這已影響特勤中心要在各副總統參選人住家旁租屋保護的部署進度，所幸這3組副總統候選人都居住在台北市區內，負責各組副總統候選人的特勤人員還可以暫住在大直的特勤中心營區內，僅留貼身的特勤隨扈在候選人家中居住，待租屋確定後再把整組人員遷入居住。
