此此九合一大選意外掀起論文抄襲風爆，立法院10日針對明年度中央政府總預算案進行朝野黨團協商，針對國安局預算相關提案時，國安局長陳明通疑因不滿遭國民黨團指對前新竹市長林智堅論文抄襲案掩護圓謊，當場反駁，「林智堅的案子，很確定是一個冤案」，引發討論。
原預計轉戰桃園市的林智堅，在選戰期間因台大國發所碩士論文案遭認定抄襲，黯然退選；而上月剛卸任的前桃園市長鄭文燦，國發所論文也在選後遭學倫會認定抄襲，而兩人的時任指導教授正是陳明通。
審查期間，國民黨團指出，陳明通擔任台大國發所教授期間，利用學術地位政學兩棲，更為林智堅抄襲案掩護圓謊，連桃園市前市長鄭文燦也爆出論文抄襲，要求陳明通公開向國人道歉、立即請辭下台。
隨後，陳明通於提案過程中主動發聲，林智堅的案子確定是冤案，明天法院要開議，所有的證據包括國民黨立委曾銘宗、溫玉霞都看過，這是一個冤案，自己無法接受這樣的提案。連在一旁的民進黨團總召柯建銘，也表示同意陳明通說法，連聲附和喊「對」。
