行政院副院長杜紫軍13日視察0206震災中央災害應變中心第20次工作會報，表示14日將召開震災優先處置研商會議，災後重建工作即將開始，中央將充分配合地方，請相關部會預為盤點法規及預算，以最有效率和彈性的方式協助重建。
副指揮官內政部政務次長陳純敬指出，已請各部會持續建物評估、收容、心理建設與輔導等工作。由於目前失聯尚待搶救者是個位數，陳純敬已請內政部消防署持續與台南市政府聯繫，了解後續搶救情況及有否需要進一步支援。
陳純敬也指出，隨氣溫持回升，衛福部等相關部會將依救災進度，針對現場及災區的衛生及防疫提供必要協助，避免傳染病流行。另外，水電維生組表示，目前尚餘5000戶停水，感謝經濟部及自來水公司的辛勞，仍請大家再加把勁，儘速恢復正常供水。
