國民黨中央雖不反對藍白合作制衡民進黨，但對柯文哲及民眾黨在地方上的動向卻是高度警戒。一位資深黨務人士質疑，柯Ｐ與民進黨決裂後，已拿不到綠營選票了，民眾黨在各地找的選將多有藍營背景，只要稍有民意基礎就來者不拒，明顯是要挖國民黨的牆角。
這位黨務人士警告，國民黨在地方上面對綠營競爭已很吃力了，若再與民眾黨走太近，混淆兩黨界線，縣市議員席次恐因白營分票而折損。更大的麻煩是，部分選情緊繃的藍營縣市長，為連任得爭取民眾黨支持，而柯Ｐ也刻意釋出不排除在北市支持蔣萬安的訊息，藉此博取藍營群眾好感。長此以往，成功吸收部分藍營選票的柯文哲，一旦確定投入總統選局，國民黨將面臨未戰先敗的險境。
