對於我方在馬航空難前曾接獲恐怖攻擊中國情資，但國安系統並未對此警訊提出因應作為，被立委林國正批評不能因國安首長要換人，就讓整個國安系統放鬆，但國安局副局長王德麟表示，已依權責提昇機場安檢措施，並由各單位強化安全工作。
警政署長王卓鈞在立法院表示，華航營運安全處3月4日中午接獲一名操國語口音，自稱法國反恐組織成員的電話，稱有東突組織要循昆明火車站恐怖攻擊模式，針對北京機場或地鐵進行攻擊。華航在下午1時55分將此情資立即通報航空警察局勤務指揮中心，警政署是在2時20分接獲航警局的通報，經過警政署對情資的辨識後，通令各個機場和車站加強安檢依程序，在3點50分向行政院國土辦公室通報，並依兩岸共同打擊犯罪協議機制，將此訊息通知大陸。
但是立委林國正詢問表示，當天接獲恐怖攻擊情資後，航警局是以傳真方式通知警政署勤務中心，警政署保安組再將此傳真傳給國安局，對於這樣重大的情資，國安局至今並未邀集相關單位召開過任何因應會議，甚至接獲重大情資後，都是傳真方式來傳達訊息，直到現在連這通電話是國外還是國內打來，都還沒查出來，國安系統的螺絲真的都鬆了。
對於立委的質疑，警政署並未解釋說明，但國安局副局長王德麟表示，各單位都依權責處理，國安局也依規定通知國安會。
至於外界質疑國安局接獲恐怖攻擊情資後，危險等級還是維持綠燈，還將情資提供給中國一事，國安局長蔡得勝表示，這次的情資屬於犯罪的恐怖攻擊，基於全球反恐工作的聯繫，警政署依兩岸聯合打擊犯罪的機制將情資告知中國。
