衛生福利部自2013年起力推「美容醫學品質認證」，無奈醫療院所不埋單，1年多來全台近800家醫美機構，僅有27家通過認證。
為因應層出不窮的醫療糾紛，衛生福利部去年委託醫療品質策進會籌辦醫美認證，針對提出申請機構的人員資格、場所設備及服務品質等表現進行審核，只要符合醫策會制定的20餘項標準者，就發給「光電及針劑注射治療」的綠色標章，以及「美容手術」的紅色標章，希望導正醫美市場亂象，只是推動以來成效不彰。 衛福部甚至發現，已通過醫美認證的機構裡竟有11家違規，包括操作未經人體試驗的療程、違規醫美廣告促銷，或由不具醫療人員資格的諮詢師違法提供醫療診斷等。
有整形外科醫師表示，政府公信力不足，導致業者對認證興趣缺缺，再加上網路行銷、部落客推薦遠比政府背書來的有效，業者自然不願透過繁雜的程序申請認證。此外，也有醫師指出，政府推出的醫美認證定位不明確、不精緻，才會導至民間機構興致缺缺。
也有醫師認為，就算沒有醫美認證，醫學中心的整型或醫美部門都還是能繼續做醫美，「半路出家」的跨科別醫師同樣也能執業，實在沒有必要再申請一個「沒有實際價值」的認證。
衛福部醫事司長李偉強則認為，目前參與醫美認證不踴躍的原因，在於條件過於嚴格，許多醫美機構因而打退堂鼓。此外，他也表示，衛福部今年特別要求各縣市衛生局，將部分醫美認證項目列入加強督考標準，「逃避認證，不代表可採用較低標準執業。」
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