關於全球大學的排名，一般熟知的有四種（英國Times報的THE、英國Quacquarelli Symonds 公司的QS World University Rankings、上海交通大學的ARWU、美國US News & World Report雜誌的USNWR）。每次發布，媒體都熱衷報導。大家會關心臺灣大學的排名是上升還是下降？又，除臺灣大學外，中國大陸及香港的大學有多少是在兩百名內？還有，前一千所大學中，臺灣有多少大學入榜？相關的檢討文字已有許多，本文不贅。
另有一種排名，是關於學術研究機構（包括純研究機構及研究型大學）的基礎科學研究成果的，似乎在臺灣還很少人注意到；那就是Nature Index的排名。這一排名是Nature期刊自2015年開始做的，方法是選定基礎科學各領域最重要的期刊82種（包括Nature旗下18種期刊，及Science, Cell, Physical Review Letters, The Astrophysical Journal Letters, The Journal of Physical Chemistry Letters, Advanced Materials等等）。有AC與FC兩種計點法。AC（Article count）指論文數：只要是論文作者中有一人來自該機構，就計1點；FC（Fractional count）指「貢獻值」：每篇論文點數為1，若有N位作者，則每位作者的貢獻值計為N分之1，然後就每一機構加總。
科學研究注重原創；事實上只有極少數論文能引領風潮而樹立典範，而其他大部分論文則或附和助成，或只在小眾間相觀而善。反映在學術期刊上，則上述82種頂尖期刊的影響指數（impact factor，即該刊的每篇論文平均引用次數）遠遠超過一般學術期刊（例如Nature的影響指數有43.0，而一般期刊有1.0就算不錯了）。因而，一個機構在頂尖期刊上發表論文的多寡，的確可以顯示其學術研究創新的水準。
2015年整年的FC排名，前5名依序為（案：括弧裡的數字就是前述「貢獻值」）：中國科學院（1620.68）、美國的哈佛大學（886.99）、法國國家科學研究中心French National Centre for Scientific Research（790.39）、德國的普朗克研究所群Max Planck Society（745.18）、美國的史坦福大學（636.11）。北京大學排名第14（369.66），清華大學（北京）排名第28（278.86）。此外，日本的東京大學排在第8（526.72），新加坡國立大學第45（212.00），南韓的首爾國立大學第65（166.93），香港科技大學第138（100.68）。 （相關報導： 為何GDP成長，實質薪資卻沒成長？錢是否都進了老闆的口袋？中研院研究員：當年押錯了寶 ｜ 更多文章 ）
與之相較，2015年臺灣最佳的三個基礎科學研究機構是：國立臺灣大學第108（115.83）、國立清華大學（新竹）第190（79.15）、中央研究院第194（77.54）。許多中國大陸的大學都排在前面；江蘇省屬的蘇州大學近年異軍崛起，排名第80（140.7），值得注意。
