有媒體報導，台北地檢署上周赴台北農產運銷公司調閱董監事會議紀錄及員工出國招標帳冊，偵辦高雄市長韓國瑜任職北農總經理期間涉及的背信案，發現韓國瑜在2013年上任北農總經理後，公司營業淨利逐年增加，4年間淨利成長了2.5倍。該報導指，北農因業務量及業外收入淨利增加，每年累積上千萬元未入帳的「超額盈餘」都成為了韓國瑜的私房錢。
《鏡週刊》報導指出，檢方調查北農各年度的會計帳冊，北農營業淨利在2010年便開始穩定成長；韓國瑜上任後，隔年淨利1800萬元，並逐年增加，至2017年已有5800萬元，4年間淨利成長2.5倍，蔬菜平均交易價從20元漲至28元。報導指稱，北農每年營收都會列入隔年度的會計帳內，但因業務量及業外收入淨利增加，每年累積上千萬元不等的「超額盈餘」未入帳，這些錢都變成韓國瑜的私房錢。
此外，《鏡週刊》報導還稱，據知情人士透露，北農之前提供北檢的資料僅能確認韓國瑜在任內濫發數千萬三節獎金，除此之外，韓國瑜還巧立名目新增獎金項目並犒賞員工出國旅遊；這些本都應依照審計程序繳庫回饋給官股，但韓國瑜卻沒有這麼做，「韓國瑜濫發北農賺到的超額盈餘，就是一本沒曝光的爛帳。」
韓國瑜澄清：所有支出一切都合法
對此，韓國瑜今（26）日上午接受國民黨副主席郝龍斌在高雄中廣電台的訪問時說，北農是民營占55%的公司，權力最大的單位是股東大會決算審查完畢，相關資料都經股東大會通過，所有支出一切都是合法的。 （相關報導： 國民黨政見會後》誰能擊敗執政黨？韓國瑜PK郭台銘，爆料公社模擬投票74%網友都挺他… ｜ 更多文章 ）
韓國瑜表示，有人透過檢調及各種不正當的手法打擊國民黨總統候選人，不解「現在查有何意思？」他盼不同政黨理性競爭，不要抹黑造謠，否則只是傷害台灣。
