蔡政府將「轉型正義」列為重點施政，亦陸續立法成立不當黨產處理委員會、促進轉型正義委員會，並由文化部推動中正紀念堂之轉型、再民主化，然相關人士憂心，《政治檔案條例》未完成立法，尚難完整清查國民黨所持有之政治檔案、簡化檔案解密程序、揭露加害者體系，以及放寬政治檔案之開放應用，目前轉型正義仍缺一塊拚圖。
東廠事件後促轉會社會聲望重挫
惟據了解，促轉會去年發生「東廠事件」，重挫其社會聲譽及正當性，正副主委至今仍懸缺未定，代理主委楊翠頻頻成為藍營箭靶，僅管《政治檔案條例》雖列為優先法案，然綠營內部考量，如貿然推動，恐再成藍營攻擊焦點，模糊轉型正義初衷，「目前沒有太明確的討論（指推動）。」
民進黨立委尤美女表示，《政治檔案條例》處理兩大部分，其一針對政黨及附隨組織所持政治檔案之清查，其二為加害者的揭露，但須有細膩規定，因加害者體系複雜，受難者也可能是加害者，其界線不明，例如當年有不少「互咬」案例，如全面公開，「對受害者也是傷害」。
談及清查國民黨政治檔案，尤美女說，在威權時代「黨國不分」，國民黨現階段只願意提供已公開之檔案，「敏感的東西大概不會拿出來」。因此，必須透過立法，賦予促轉會權力，要求國民黨移交。
在政治檔案解密部分，尤美女指出，很多政治檔案早已過解密年限，但機關卻以各項理由推託，人民最想知道的林義雄案、陳文成案、江南案的檔案若無法解密，案子永遠不會破，各單位仍存有角力。
尤美女：不是所有政治檔案都須全數解密
尤美女也提醒，促轉會工作非常重要，不是所有政治檔案都須全數解密、對外公開，必須評估其開放程度，關於如何解密、解密程度、對誰解密都須詳加考量，例如受難者或當事人、歷史研究者、一般民眾的開放程度應不同，否則恐造成社會撕裂。
被問及朝野氣氛不利推動轉型正義一事，尤美女則表示，此氛圍如果不解開，歷史真相很難呈現，轉型正義不是促轉會完成調查報告就結束，而是一個「起步」，讓社會共同面對，進行和解。
陳儀深： 政治檔案法才能解決個人資料保護法的限制
中研院近代史副研究員陳儀深受訪表示，政治受難者關切《政治檔案條例》立法進度，因轉型正義重點在於呈現真相，如完成立法，才可賦予各機關政治檔案徵集以及檢討解密之義務，否則依照現行法，會「拖拖拉拉搞很久」，民進黨應趁著國會多數，趕快處理。 （相關報導： 永遠不知道有沒有人在盯著你…那年光復橋上一場悲劇 一揭憲兵「橋哨」勤務的前世今生 ｜ 更多文章 ）
陳儀深指出，根據現行法令，個人資料保護法、國家機密保護法與檔案開放的關係，彼此互相衝突，唯有《政治檔案條例》始可解除限制，但開放亦非毫無限制，須評估其內容輕重才決定開放程度，但此工作「沒那麼容易。」
