仍有不少人反對台灣加入亞投行，黑色島國青年陣線及臺左維新組成的聯合團體聲明，反對的理由包括：1.反對台灣盲目追隨經濟強權的金融資本主義競賽；2.中國藉著亞投行的各國資金來增加權力；3.對環境、勞工人權的堅持；4.黑箱過程、一人決策、賠上全國，以及5.意向同意書未照應有程序、矮化主權。而台聯黨團反對的理由則是反對黑箱程序、一人決策。
另外，中經院WTO及RTA中心副執行長李淳也為文表示台灣加入亞洲開發銀行（ADB）已久，實質利益有限，而目前加入亞投行甜頭恐怕也有限，又觸及敏感的名稱、席位等矮化議題，籲台灣應「稍安勿躁再想想」。
而民進黨主席、總統參選人蔡英文則批評，馬政府選在截止日期前急急忙忙送出申請意向書的作法草率，蔡英文認為，參與國際組織應有更完整的評估，並充分與社會溝通。
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