第三屆「海洋與台灣學術研討會」22日下午閉幕，與會的學者專家與部會通過「海洋行動綱領」，呼籲馬英九總統在「東海和平倡議」之外，於南海建構類似的合作機制，積極參與週邊國家解決領海爭議及漁權糾紛的對話。
此外，主導研討會的「海洋事務推動委員會」多年來力促政府成立海洋事務專責部門，對於「海洋委員會」組織法在立法院遲遲未獲通過，發起人之一、台灣研究會會長黃煌雄表示，海洋事務應是跨黨派議題，立法院應該加快審查速度。
於2002年首次召開的「海洋與台灣學術研討會」，歷經政黨輪替，今年舉行第三屆會議。因應近年來週邊海域屢屢發生漁事及主權糾紛，此屆研討會特別針對海洋外交、主權與漁權，及海上安全等議題，邀請學者、國防部、海巡署與漁業署等官員共同討論。
兩天會議後，大會決議向總統府提出35點「行動綱領」，呼籲政府儘速回應。綱領中針對海洋戰略提出，為促進區域和平、經濟繁榮及海洋生態永續發展，政府除持續推動東海和平倡議外，也應在主權及漁權爭議更為複雜的南海建構類似機制。
綱領並指出，為積極參與南海爭議的解決機制，政府應規劃海洋戰略，並因應特定海域的突發狀況，「宣示國家立場」，以支援海洋及外交部會機關的對外作為。此外，綱領也建議海洋事務機關應能夠統合國軍、海巡及漁政， 以與外交談判相互支援，以確保海洋權益。
事實上，台灣在南海的主權爭議較之東海更為複雜，但南海相關國家對主權爭議已有「南海行為準則」等主張，基於相關國家均奉行「一個中國」原則，幾度對話均未邀請台灣參與。
而針對我國週邊海域的漁權糾紛與主權爭議，馬英九在研討會開幕時曾透露，儘管我國與日本、菲律賓採取擱置主權爭議、共同開發資源的原則，展開對話以建立爭端解決機制，但中國卻因涉及主權概念，遲遲不願與我展開協商。
黃煌雄對此指出，當前台灣海洋事務最迫切的實務議題之一，就是週邊海域主權與漁權的問題；目前主要負責的海巡署專業在於護漁，但相關外交談判、資源開發及生態保護等問題，還是需要其他部會協助，最有效的解決方式就是儘速通過「海洋委員會組織法」，讓委員會儘速掛牌運作，整合處理相關爭議問。
副總統吳敦義則在閉幕儀式上指出，從釣魚台爭端及台菲廣大興事件，可以看出四面環海的台灣必須正視海洋安全的重要性；針對海洋委員會的推動，行政院將整合內政部、交通部、農委會等部會之力，積極與立法院溝通促成。
