最近，因中研院選院長，有院士說討論中研院的存廢更重要。之前已有因技轉與商利迴避等案，引人檢討，例如，某科技大老主張，中研院和大學儼然是學術界的「一國兩治」、中研院應「解甲歸田」 併入大學；聲援者包括前部長與立委。
話說1928年，我國創建中研院，模仿德國科學院，而非美國國家科學院；前者內建研究所，而後者否。此設計影響國家科技發展，例如，德國自認其大學水準不及美國的主因之一是，美國「藏富於民」，一流科學家在各校各地育才傳承，下一代「站在巨人肩上」而更有成。法國前農業部長也讚賞美國的制度設計。
我國中研院早該轉型。首先，名實問題。它號稱我國學術研究最高機關，具三任務「人文及科學研究、指導聯絡及獎勵學術研究、培養高級學術研究人才。」其實是灌水一任務「學術研究」。中研院直屬總統府，預算直接撥出，立委質問是否有年度報告書和KPI評估？總統府有能力審查？負責業務的總統府第一局卻迴避質詢。另外，國科會也宣稱「學術研究」為其任務；我國怎呈「雙頭馬車」窘境？
第二，爭取預算優勢。例如，翁曉玲立委指出，2025年大學研發訓練預算，台大4232萬元，但中研院光是法律所的業務費就4107萬元。又如，在《立法院公報》，立委指出2015年度決算中， 51所國立大學的教學及研究費412億元，平均每校8億元，但中研院科研基金52億元，其中26億元公務預算，22億元科技部補助。中研院原預算143億元加上52億元，近200億元的預算到底可以給國家帶來什麼？若將中研院200億元給台清交成，他們就可打世界盃啦。廖院長回應，中研院設立的目的是集中全國最好的人才與設備，做一流的研究。唉，大言不慚；最近，世界頂尖期刊《自然》公佈全球排名，台大第184名、中研院第294名（每況愈下：2015年第190，2018年第206）。廖院長在立法院也是稱其為我國學術研究最高機關，「最高」實為搶預算用雞毛當令劍嗎？
第三，應即改成大學。總統府哪需「學術研究最高機關」？諸如美國國家科學院與英國皇家學院均虛級化，亦即不設科研單位，院士均為大學或公司的人員。我國諸多院士旅美，深諳美國制度設計與其優勢，為何不會自動改弦易轍？當前大學偏多，就改成某大學南港校區。為拉拔大學，我國曾砸下五年五百億等巨資，院士與研究員該負大學育才之責吧？
1979年，李國鼎政委創建「行政院科技顧問組」，工作之一是協調國家科技預算。因國家分配預算時，各單位「搶錢」，誰能客觀公平分配呢？通常國科會分配科技預算，淪為「球員兼裁判」，結果改為科技顧問組分配。但1994年李遠哲接掌中研院後，反對行政院審其預算，其諾貝爾獎光環讓中研院預算快速高漲；立委質詢中研院研究員與博士生數，約台大的七分之一，預算卻與台大相近，中研院又不受大學法規範而讓大學反感。
2020年，《科學月刊》專文〈科技部回復成國科會，臺灣科學發展會更好嗎？〉，顯示決策者大致不知「球員兼裁判」，遑論其害。早年，李國鼎曾在攬才場合提到：「如果你們這些一流的人不到政府來，來的是二或三流的人，國家由二或三流的人制訂政策，領導一流的人，到時你們就知道痛苦了！」善哉斯言。
中研院「行禮如儀」近百年，袞袞諸公不揭露「國王的新衣」。現在「風雨如晦，雞鳴不已」，該從「最高」醒來，亟將中研院轉型。 （相關報導： 風評：李遠哲的後花園，真的非陳建仁不可嗎？ ｜ 更多文章 ）
＊作者為大學教授
