由法務部等部會組成的專案小組正在中國就肯亞案台灣嫌犯問題進行交涉，總統府21日公布馬英九總統19日接受新加坡《海峽時報》（The Straits Times）專訪。馬總統在專訪中表示，肯亞案是兩岸享有共同管轄權的案件，「嚴格來說，並不涉及到主權問題，而是雙方分工的問題」。
馬：兩岸雙方享有共同管轄
原規劃在18日前往中國交涉肯亞案的專案小組，在準備工作及對岸延宕後於20日中午抵達北京，就遭羈押在中國的45名台灣民眾法律處遇問題展開交涉。在第一時間舉行國安會議要求中方儘速放人後，未再對此事公開發言的馬英九，19日藉由接受《海峽時報》專訪表達立場。
馬英九認為，肯亞案基本上屬於「兩岸雙方享有共同管轄」的犯罪案件，這類案件其實有前例可援。根據2009年簽訂的《兩岸共同打擊犯罪及司法互助協議》，雙方應該先行諮商，再確定由哪一方或者共同處理案件。馬英九表示，2011年菲律賓發生的台嫌遣中案，處理方式是中國先進行偵查，也有台灣檢察官參與，最後中國的部分完成後送還給我方，由台灣繼續偵辦。
馬：中方事前未協商、處理程序不透明
馬英九說，此次案件讓台灣感到不滿的，第一是中方在事前並沒有與台灣諮商，第二是處理程序不夠透明，讓外界無法了解到底基於什麼犯罪事實與證據來辦案。馬英九說，「這些問題嚴格來說，並不涉及到主權問題，而是雙方分工的問題。」
對於法務部等部會組成的專案小組赴中國交涉，馬英九說，小組將與中國方面討論此案的分工原則，另外希望就馬來西亞案以及其他案子，能夠有一個通案的處理方案。馬英九特別強調，此一「通案的處理方案」就是共同管轄、分工合作。
共同管轄、分工合作
對於外界將此案解讀為兩岸主權之爭，並認為北京有意藉此在520前發揮影響力，馬英九說，蠻多人這樣想，但他不認為這是唯一的原因。他認為此案發生爭議的最主要原因，在於過去我方處理類似的案件時，中國方面對台灣的審判結果不是很滿意，往往刑度與中國有相當的落差，因此中國認為台灣比較輕判，使他們對於把嫌疑人遣送到台灣不滿。
但馬英九強調，在台灣的司法制度中，法院的運作是獨立的，政府不能干預；其次，台灣是根據法律審判，法務部以及檢察官能在法庭呼籲法官從重量刑，如果法官沒有做到還可以上訴，但是不可能做最後的決定，所以兩岸的司法制度在此一議題上有所不同。
馬：我應檢討如何加重求刑
馬英九說，其實可以檢討將來檢察官在辦案時，用什麼方式能夠加重求刑；實際上台灣並不是法律規定得很輕，因為罪嫌詐騙都不是只有一次，我方現在可以用「一次一罪」的方式來辦，也可以判得非常重，這方面是台灣要檢討的地方。馬英九認為，這方面如果能夠做到的話，相信未來處理時就會有清楚的原則可以適用。
馬英九也說，肯亞案要在520前有具體結果並不容易，因為中國還在進行調查，我方也許可以去了解、觀察，可是要在調查完成之前把台籍嫌犯帶回來，可能性非常小。
