台北地檢署偵辦台灣醫界歷來最大逃漏稅案，中央研究院院士蔡作雍創立的「思源教育學術促進基金會」，以及李鴻（已死亡）創立的成漢教育基金會，涉嫌協助數百名醫師「假捐贈、真逃稅」。北檢9日偵結，三總醫師吳佳駿等27人不認罪被依違反《稅捐稽徵法》起訴，僅1人罪證不足獲不起訴，另225人緩起訴。蔡作雍、李鴻與大部分涉案的不肖醫師，都是國防醫學院校友。
調查局台北巿調查處接獲國稅局檢舉，指國防醫學院前院長蔡作雍等人疑透過思源、成漢兩個基金會，涉嫌協助上百名醫師捐款人「假捐贈、真逃稅」，經約談蔡作雍及捐款醫師等人後，移送台北地檢署偵辦。
檢方指出，思源基金會董事長蔡作雍、執行長傅鍔以及成漢基金會董事林欣榮、執行長徐偉成等人從民國94年起至98年，接受逾200名醫師捐款，基金會再以補助研究費方式，扣除5%的行政費用，「回流」捐款總額的9成5給捐款人，協助這些醫師「假捐贈、真逃稅」。
合計這些醫師「捐款」逾新台幣2億6304萬元，逃漏稅逾7840萬元。大多數醫師已向國稅局坦承逃漏稅遭裁罰，並已繳交罰金。
蔡作雍等4人均坦承犯行，被依幫助犯身分，獲得緩起訴，蔡作雍須繳35萬元給國庫，傅鍔繳57萬元，林欣榮繳44萬3000元，徐繳21萬元，其中傅、林也有捐款並申請研究補助，因此緩起訴金額較高。至於李鴻，已在去年死亡。
認罪的捐款醫師中，包含蔣明富等逾200人獲緩起訴，須繳45萬元至3萬元給國庫；不認罪的捐款醫師中，包含吳佳駿等27人則被依違反《稅捐稽徵法》起訴；另一名捐款醫師因未申請研究補助，獲不起訴處分。
蔡作雍現年87歲，廣州人，1953年畢業於國防醫學院醫學系47期，留校任教，專攻生理學。1966年獲得美國哥倫比亞大學博士，歷任國防醫學院生理系教授、系主任、教務處處長、教育長、副院長。1975年至1983年擔任院長。1978年當選中央研究院院士，1980年至1987年任中央研究院生物科學研究所籌備處代主任。
2011年7月，蔡作雍因為涉嫌透過自己創辦的「思源教育學術促進基金會」，協助數百名醫師逃漏稅，遭到司法機關調查。涉案醫師以國防醫學院校友為主，大多在三軍總醫院任職，也有人轉任台北和台中榮總。
