台灣最知名的戴奧辛汙染事件—台南中石化安順廠，居民對經濟部及中石化公司提起國賠及侵權損害賠償，在纏訟10年後，最高法院11月28日三審判決中石化應賠償400多位居民共1.8億元，但駁回對經濟部的請求。判決出來後，最早揭發中石化汙染的學者黃煥彰表示：「這是一個沒有公理真相的判決」。
黃煥彰會這麼說，是因為經濟部才是中石化實質的汙染行為人，雖然中石化在合併原台鹼公司後，依公司法須概括承受台鹼公司的權利義務，但這指的是產權移轉，不能抹滅經濟部才是汙染行為人這件事。最高法院判經濟部免國賠存在相當大的爭議，還有待日後釋憲，但無論如何經濟部還欠居民一個道歉。
1942年日本在台南興建鹼氯工廠，國民政府接收後改名為台鹼安順廠，1964年增設五氯酚廠。產權方面，1946~1966年由經濟部及省政府擁有，1967年~1982年由經濟部國營事業中油公司擁有。1982年台鹼關廠，1983年台鹼併入同屬經濟部國營事業的中石化公司，1994年中石化公司民營化。
也就是說，在台鹼公司併入中石化之前，工廠營運者都是經濟部，因為製造而產生的土壤及地下水汙染，責任當然是經濟部。而中石化併入台鹼後雖然沒有生產行為，但也要負善良管理人的責任，因此兩者理當共負賠償之責。
居民在不知情下飽受汙染之苦
2010年環保署比照美國超級基金實施土壤及地下水汙染整治法，之後對中石化安順廠做大規模調查，發現包括海水貯水池、鹼氯工廠、五氯酚工廠、植被區、草叢區、二等九號道路等擴及36公頃廠區都有汞及戴奧辛汙染，濃度最高達每公斤1760萬奈克，當年參與研究的學者說，這差不多已經是純戴奧辛了。
而在土汙法實施前，也歷經超過10次調查，在土壤、地下水、海水貯水池的底泥、魚體檢測都發現戴奧辛或汞汙染，甚至發現居民血液戴奧辛濃度超過正常值，直到黃煥彰在一次田野調查時發現，才揭發中石化安順廠的汙染。
汞及戴奧辛汙染從何而來？台鹼安順廠採用水銀電解法，推測安順廠的汞汙染來自汞汙泥堆置、含汞廢水排放等。而製造五氯酚的不純物就包括戴奧辛。
如果經濟部沒有責任，為何同意支付13億人道關懷費
這些汙染對當地居民來說，不只是致命的傷害，連生活也完全改變。同樣也遭受汙染的竹筏港溪下游有魚塭，居民長期引水養殖，2005年台南市環保局在現場插上「請勿垂釣」告示牌時，還引發居民跳溪抗議。居民到外地賣魚被質疑，到後來魚也賣不下去，只能轉業賣水果。
一位顯宮里居民從小到大都在海水貯水池捕魚，他的血液戴奧辛濃度200多皮克，是村民平均濃度的四倍，10幾歲時腳就不明原因變形，太太跟兩個兒子血液戴奧辛濃度都超過64皮克。類似的故事在當地比比皆是。 （相關報導： 戴奧辛污染案判決定讞！最高法院判中石化賠1.8億、經濟部免賠 ｜ 更多文章 ）
由於經濟部、中石化都不認這些汙染，2005年7月由時任環保署長張國龍、台南市長許添財在決議由政府基於「人道闗懷」補償居民13億元，經濟部負擔12億5千萬元照護費用、環保署負擔1300萬元汙染整治、農委會負擔3200多萬元收購禁養區水產品。補償金兩度展延目前總計19年、34.5億元。
