實施將近7年的日本福島等5縣食品禁令，衛福部1月29日透露可能改採高風險食品管制，待行政院裁定時間表，雖遭行政院打臉未收到公文，但日本核災區食品是否解禁輸台再度引發關注。駐日代表謝長廷強調，「跟著意識形態是非常不好的，應該有自己的決策」。
謝長廷說明，中國積極跟日本協議，有可能會開放日本核災區食品，但台灣號稱最尊重貿易自由、最根據科學，但卻是跟著意識形態再走。根據多年政府的抽查與抽驗，以及參考美國、歐盟的作法，他認為台灣「應該要有自己的決策」。
去年11月謝長廷曾針對「東北亞區域局勢與日本大選分析及台日關係發展現況及展望」作出報告，他指出，有關日本食品輸台管制，衛福部於100年3月25日宣布暫停福島、茨城、栃木、千葉、群馬等5縣市所有食品（酒類除外）進口。
謝長廷表示，目前世界各國已逐步解除或放寬日本食品進口管制，如加拿大與澳洲已完全解除管制、美國與歐盟採取放寬管制，全面禁止福島以外鄰近地區進口僅台灣與中國。 （相關報導： 風評：開放福島食品進口，綠營如何面對「昨日之我」？ ｜ 更多文章 ）
針對台日經濟夥伴協定（EPA）進展，謝長廷表示，雙方本來已經在談，也有基礎了，但因日本核災區食品進口台灣限制的問題，就暫緩了協定，他說明「希望基礎不要斷掉，但現在看起來有點困難。」
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