爭議一時的慈濟基金會因涉及將「保護區」變更為「社會福利專區」，引發保護區遭破壞的疑慮，民眾反彈聲浪越演越烈，陸續引發一系列對慈濟財務不透明等各方面的檢視，台北市長柯文哲也曾表示反對開發之意。16日下午，慈濟主動於花蓮慈濟靜思堂召開記者會，宣布慈濟內湖園區開發案即日起撤案。
慈濟秘書處高專簡東源表示，所謂「撤案」，即指未來不會再申請變更為「社會福利專區」，維持其「保護區」的土地使用，以復育、生態發展為主。
記者會中，慈濟基金會創辦人証嚴法師的胞弟、慈濟基金會副總執行長王端正發表4點聲明：
第1， 慈濟內湖園區案受到各界關注，在社會還沒有共識之前，即日撤案。
第2， 為了推動環境保護，維持生態景觀，配合台北市政府與社區居民落實內湖園區生態，在生態方面要擴大復育。
第3， 感恩社會對慈濟建言，虛心接受，誠心反省變革。
第4， 慈濟基金會將擴大董監會組織，邀請社會有公信人士，參加慈濟基金董監事會，代表社會來監督並策勉慈濟運作，來提升改善方案。
此4點回應了變更「保護區」為「社會福利專區」的爭議，即未來不會再申請變更用地，將配合內湖區民眾對生態方面的顧慮，此外，將納入外部公信人士，監督慈濟在各方面的運作。
針對財務透明的問題，慈濟副總執行長林碧玉表示，將從本月20日開始，只要過去提供身分證字號的會員，均可用會員編號在網路上查詢款項已確認捐入慈濟帳戶。3月25號開始慈濟將分階段做財務收支報告，並公布4大志業收支。
