新冠肺炎（武漢肺炎）疫情影響已持續超過2個月，國內大專院校在境外國人開始返台後也陸續傳出疫情，至截稿為止，已有6所大學出現確診。目前指揮中心對於風險追蹤分為3種模式，第一為與確診者有接觸者，需進行14天居家隔離；第二為具外國旅遊史者，需進行14天居家檢疫；社區監測通報採檢個案等狀況者，則需自主健康管理。此外，目前大專校院停課標準，教育部規定若有1位師生確診，該師生參與課程停課；2位以上師生確診，則該校（區）停課。
不過，面對學生上課往來頻繁，以及常見合住宿舍等情況，各大學大多不會只遵循中央規定，而是紛紛拉高風險監控層級，如成功大學便擴大追蹤，凡與需居家隔離人士接觸的師生，一律停止實體授課，這套模式後來也被清華大學、政治大學採用，被稱作是「第四種模式」；而台灣大學則在面對中研院爆發疫情時，祭出針對校內的「校園健康管理」方式。
挾醫學優勢 成大搶先CDC擴大追蹤範圍
大專院校的首例病例出現在成功大學，校方3月17日凌晨緊急向7門課超過500位學生發出簡訊通知，將相關課程改為線上教學，並請同學自主健康管理。指揮中心則在當日下午證實，該校一名學生為新增確診案例，8日自德國返國後，主動跟學校聯繫報告旅遊史，並於校外租屋處自主健康管理，回國到確診期間，都沒有進入校園，僅跟2位友人在校外聚餐。成大也於隔日宣布，確認2位友人上課狀況後，共有111人需要自主健康管理。
但匡列500人的規模不算小，因此一度引發校內師生驚慌，對於當時如何在第一時間做此決定，成大主秘李俊璋表示，是因為成大有醫院，也是重點篩檢醫院，才比較能夠在第一時間清楚做決策。
李俊璋談到，這名學生3月8日從德國返台，到10日前一直都是在家的狀態，直到3月11日開始聞不到味道，才趕緊於16日到成大醫院耳鼻喉科掛號。據了解，學生在門診大樓掛號時，因健保卡顯示有旅遊史，於是被帶去篩檢，「只要成大教職員工生去篩檢，成大醫院就會立刻通知學校，所以我們3、4點收到醫院通知，就開始備戰了。」
當時，成大衛保組長馬上透過電話聯絡學生進行疫調，掌握11日起所有行蹤，才確定他期間有與2位同學吃過飯，因此緊急通知2位同學可能須進行隔離，同時調出選修課程共7堂、匡列相關學生，並在晚上11點多接到確診通知後，第一時間發出簡訊。
李俊璋回顧，那天相關人員都忙到直到凌晨2、3點，隔天一早到學校，才想到11日是星期三，到16日星期一之間，只有星期四、五、一這3天要上課，因此進一步限縮範圍，並且確認2位同學只有上過2堂課後，就趕緊再發通知，匡列111人。
