自由經濟示範區特別條例草案今年1月送入立法院，本會期審查卻毫無進展。國民黨召委黃昭順將在下週三5月28日邀請示範區「六港一空一區」縣市首長出席審查會，一方面逼迫民進黨立委與縣市長整合立場，一方面凸顯綠營在示範區議題上的自我矛盾。
示範區包括智慧物流、金融服務、國際醫療、農業加值、教育創新五大項目，民進黨立院黨團對於優惠減稅、鬆綁土地、鬆綁醫療、進口農產、鬆綁教育都有意見，林義雄更在反核四禁食結束當天，呼應公民團體提出「擋下示範區」主張，部分公民團體甚至以「自經區形同自殺區」提出強烈批判，新成立的「島國前進」團體，更在各縣市舉行「反示範區」說明會，反對聲浪有越演越烈趨勢。
民進黨中央保守vs地方開放
問題是，民進黨有三個執政縣市屬於示範區「六港」（高雄港、台南安平港、宜蘭蘇澳港），屏東縣也有「屏東農業生技園區」屬於特許開放。地方父母官為了招商引資，促進地方經濟發展，很難全盤否定示範區的正面作用。
以台南為例，原本並未列入示範區的第一波名單，後來經過賴清德市長爭取，才在2013年8月增列，當時賴市長在出席中山高新增大灣交流道動土典禮時即表示：「台南爭取安平港升格為自由貿易港區，如今也確定加入自由經濟示範區，將和台北港並列，優先規劃為快速貨運港」。緊鄰安平港的台南安平工業區，約有600家廠商進駐，2013年接任安平工業區廠商協進會理事長、目前也是大陸台企聯常務副會長的江蘇台商劉顯模，也語重心長提醒：「示範區對台南安平是一個重大的發展契機，台灣必須走出去，而且動作要快，如果特別條例修得太多、拖得太久，恐怕預期要發揮的效益會受到影響」。
高雄市長陳菊也指出：「高雄對於發展自由經濟示範區的訴求，包括亞洲新灣區、市府與港務公司合作的自由貿易港區等，同時引進新興、高附加價值的服務產業，切勿開放藍領外勞，反對示範區成為另一個加工出口區」。陳市長表態支持「對高雄有利」的示範區條例，主要憂慮有二：一是設置太多示範區，難以集中全國資源；二是高雄農業屬於小農，設立農產品加工區不符實際。
由於民進黨中央與地方明顯有不同意見，加上黨主席改選在即，立院黨團並未呼應林義雄要求全面擋下，而是表示要逐條審查，但為了保持政策彈性，又拒絕一次提出黨團版本，反而宣布要在審查個別條文時逐條提出修正案，明顯是要拖延審查進度，試圖拖到蔡英文主席上任之後，再來進行黨內整合。
民進黨立委持續杯葛拖延，國民黨只好把箭靶轉向民進黨縣市長。國民黨副主席兼秘書長曾永權已在5月初下達中央地方夾擊策略：在地方議會，下令國民黨籍台南+高雄議員逼問賴清德+陳菊「是否支持自由經濟示範區？」另外在立法院，也透過國民黨召委黃昭順在5月28日使出「中央逼迫地方」絕招，邀請「六港一空一區」縣市長出席，包括基隆、宜蘭、新北市、桃園、台中、彰化、台南、高雄、屏東等地縣市長，要求「地方首長明確表態，若不需加入就宣布退出」，也是為了凸顯民進黨的中央與地方矛盾。受困於民進黨主席改選、黨內意見遲未整合的困境，賴清德+陳菊兩位市長已經表示不便出席。
