民進黨執政一個月，鐵路、公路、航空卻接連出包，馬政府時代擔任閣揆與交通部長的毛治國，在臉書上批評台中、高雄市長爭取桃機分流做法失當，毛的說法在23日行政院院會引發口水戰，行政院副院長林錫耀表示，桃機、台鐵出包主要是陳年積弊導致，毛治國在馬政府任內擔任過交通部長與行政院長，對於今天桃機與台鐵積弊也有責任，對於毛的說法，他表達「遺憾」。
新政府上任一個月，桃機、台鐵紛紛出包，前馬政府閣員卻在臉書上放炮，讓林全內閣頗為火大。林錫耀在臨時動議中，特別對於桃機淹水事件發言，他說，桃機是機場經營者未盡責任、嚴重失職，除了應該在二、三天內撤換董總外，交通部也檢討原因，先前行政院要求桃機提出檢討報告時間已經快到了，這部分請政務委員吳宏謀確實督導。
林錫耀話鋒一轉，質疑新政府上台後一個月，華航卻先後發生機師與空服員罷工，為了解決華航勞資爭議，因此在這時候提出由桃園機捷董座何煖軒，出任華航董事長，希望盡快解決勞資爭議，對於台鐵花東線昨天發生出軌意外，台鐵方面宣稱是高溫導致，但林錫耀認為台鐵當初興建花東線過程，未考慮氣溫因素，顯然有明顯疏失。
行政院發言人童振源轉述，林錫耀要求交通部，後續檢討桃機、台鐵事故，「請交通部確實針貶缺失」，台鐵部分請台鐵提出內部檢討報告，並請交通部組成獨立調查小組，「前行政院長毛治國曾任交通部長多年，為何這些缺失都和毛前院長沒有關係」？對於毛發言，林錫耀表示遺憾。
行政院記者會後，童振源又針對《自由時報》報導，台電在智慧電表採購缺失，批評過去政府在裝設通訊功能的智慧電表，沒有明確作為，行政院長林全已就智慧電表使用頻寬傳輸問題予以解決，要求台電全力完成裝設，「預算方面不是問題」。
