台北市政府就大巨蛋問題，於6月8日正式發文遠雄巨蛋事業公司，限期3個月內改善，否則不排除解約，此舉被外界視為是對遠雄的最後通牒。然而，遠雄也不是省油的燈，於收到公文前2天，便發文台北高等行政法院，指巨蛋結構自重不足，恐造成水浮力產生潛變，巨蛋恐扭曲變形構成重大災害，以此請法院停止執行北市府去年520的停工處分。據了解，開庭審理的時間，按慣例，有機會在市府發文改善的3個月內審理完，即是說，在北市府還來不及對遠雄有下一步作為前，遠雄便已先發制人。
稱停工1年結構嚴重變形 遠雄欲撤銷北市府處分
市長柯文哲於5月23日在議會宣布，將向遠雄遞出限期改善公文，6月8日中午時間正式發函，就公安問題，要求遠雄1個月內表達是否有意願改善、3個月內提出趕工計畫並完成改善，否則將依約通知融資機構接管或繼續辦理興建，或者終止契約。
然而遠雄卻已先發制人，趕在市府公文到達前2天，於6月6日向台北高等行政法院，提出停止執行北市府勒令停工的行政處分，指大巨蛋停工已經超過1年，因巨蛋棟鋼構結構僅為假固定狀態，結構自重不足，造成水浮力產生潛變，水浮力一旦超過容許臨界值，將造成大巨蛋建築物結構體扭曲變形之破壞，恐即刻造成無法收拾及無法回復之重大災害，且停工期間歷經風雨寒暑，施工部分將因鏽蝕而使其設計安全性能受損，恐將造成人民生命財產的損失，依照《行政訴訟法》116條第2項規定，行政法院得裁定停止執行。
法院程序可望3個月內完結 最後通牒恐成泡影
台北高等行政法院開庭時，北市府與遠雄雙方都須到庭，就停工一事展開辯論；依照前例，此案約在1個月內就可以審理完畢，並做出是否停止北市府行政處分執行的判決，若判決應停止北市府行處，北市府雖仍可提出抗告，然而抗告審理，也有機會在2個月內完成。
換句話說，遠雄提出停止執行的舉動，有可能趕在北市府改善工安的3個月限期前，就由法院撤銷市府的停工處分，遠雄即不需面對市府的最後通牒公文，至於為什麼市府非得將時間定為3個月？據悉，是按照工程慣例，應給予對方一定長度時間改善，以完善後續可能進行的法律程序。
對此，北市府發言人林鶴明表示，不影響原合約談判，相關內容北市府律師團有所掌握，也會按原法律行動行事，不隨遠雄起舞。
