台灣海洋國土，過去幾年開啟了多起重大開發，但攸關海洋保育的「海洋三法」，竟然姍姍來遲，2019年11月20日《海洋基本法》公布施行，規定政府2年內應制定海洋空間規劃、生態系發展的相關法規，但攸關海洋生態保育的《海洋保育法》，因為經歷2021年「藻礁公投」與隔年外木山天然氣接收站（「四接」）的抗爭，相關立法工作一直到今天才獲行政院拍板。海委會主委管碧玲表示，《海洋保育法》草擬的協調過程，海委會與學者專家、環保團體、海洋產業團體、漁業團體，召開過幾次協調會議，才會有今天的法律，她感謝大家相忍，支持《海保法》，未來立法院3黨不過半，海委會會本於溝通協調的立場，爭取各黨支持。
《海洋保育法》立法過程一波三折，2022年6月8日綠色和平、台灣蠻野心足生態協會、環境正義基金會等9組民間團體，在行政院門口舉行記者會，批評《海洋基本法》2019年11月20日公布施行，規定政府2年內應制定相關法規，但法定期限已過期半年多，政院版草案卻不見蹤影，環團當時要求，行政院應立即制定海洋三法，將海洋事務法制化；並訂定相關公益訴訟機制，勿淪為宣示性法規。綠色和平指出，台灣海洋保護區雖公告有8.17%，但實際上，這些保護區通通不及格，這數十年來，漁獲量下降超過50%，也有20類魚種的漁獲量更是減少超過90%，漁業產值減少279億。
賦予主管機關5大權限、提供2大公民監督途徑 設計有3保障
管碧玲表示，海委會繼去年提出《海洋污染防治法》修正案以及《海洋產業發展條例》之後，持續與各方協商海洋保育法草案並達成初步共識，希望「海洋保育法」能順利立法，海委會於108年擬具《海洋保育法》草案，自預告後，相關環保團體、漁民、產業、專家學者及國人關注該法的進展及衝擊，提出許多建議，歷經廣泛且深入的討論與溝通，在各界不同意見中尋求社會最大共識。《海洋保育法》草案是環保團體、用海單位等相關利害團體，在協商過程高度忍讓下形成這樣的共識，讓台灣可以站在更高度理想上推動海洋保育。
管碧玲強調，「海洋保育法」賦予主管機關可以「劃設庇護區」、「管理保護區」、「公告禁限制行為」、「調查實施保育措施」、「派遣觀察員蒐集資料」等5大權限，並提供「吹哨者條款」以及「公民訴訟」等2大公民監督途徑。不過，「海洋保護區」的劃設與「公告海域禁限制行為」，都需要踐行多方溝通協商機制，在劃設「海洋保護區」以前，必須由學者專家針對海域內的生物多樣性，進行長期的研究，因此，劃設的過程會「非常漫長」，必須有科學佐證才可劃設。
管碧玲特別以美國為例，強調美國總統拜登劃設「海洋保育區」，前後花了將近10年時間，因為它必須建立在生物多樣性研究基礎之上，有一定科學基礎，「我希望台灣的海洋保育區劃設不會這麼久」。
至於「海洋保育區」會不會影響基隆外木山四接等重大國家建設？管碧玲表示，個案的開發是否會影響到海洋生態保育，需要有足夠的科學證據，因此，針對個案她不便表態。
海洋保育署署長黃向文表示，目前台灣海洋國土將會劃設為核心區、緩衝區與永續利用區，核心區除了涉及國家安全，否則原則上禁止開發，未來《海洋保育法》完成立法後，針對海洋生態系統有特別保護必要，且未經其他主管機關劃設為海洋保護區者，得劃定為海洋庇護區。
為避免影響現有用海單位之權益，該法同時設計有3項保障。首先，針對庇護區劃設以及規範禁限制行為設立審議會機制，由專家學者、民間團體以及相關機關組成，以妥為考量利害關係人權益。其次，就庇護區採分區管理，在緩衝區及永續利用區適時開放相容之利用行為，例如從事採捕海洋生物，在緩衝區內經核可得為之，又諸如鋪設電纜等海洋工程，在緩衝區以及永續利用區內，經核可亦得為之。第三，基於信賴保護原則，在劃定海洋庇護區之前，已合法取得同意、其他各項經許可或核准之行為，得繼續從事至有效期限屆滿為止。 （相關報導： 幕後》10億老本燒光、土地租約到期 國民黨的「影子內閣」苦撐待變 ｜ 更多文章 ）
另外，該法也提供公民團體參與海洋國土保育的機制，該法除了賦予主管機關，指派海洋保育觀察員在船舶、海洋設施、海域工程或周圍從事觀察、監測及蒐集資料的權限之外，也提供「吹哨者條款」以及「公民訴訟條款」2大途徑，獎勵民眾舉發違法事件，以及得就主管機關疏於執行者，直接向高等行政法院提起訴訟。
