台大新校長遴選爭議不斷，教育部人事處長陳焜元今（29）日表示，雖然台大有進行調查和釐清爭議，但需要經過台大校長遴選委員會同意，不是校方說了算，更建議台大重新開一次遴選會議，將台大的調查資料給遴選委員確認，是最快和有效的方式，如果遴選委員會確認沒問題後，教育部就會予以核准。
管中閔被選為新任台大校長後，遭質疑未主動揭露自己擔任台灣大哥大獨董，涉誠信爭議，加上遴選委員蔡明興是台灣大哥大副董，涉及未利益迴避等爭議；此外，管中閔也被民進黨立委質疑有論文抄襲嫌疑。連番疑點，讓台大還特別發布聲明澄清，強調遴選過程沒有問題。
雖然台大表示經調查後沒問題，但教育部強調，台大校長的遴選爭議，應該和日前陽明大學校長遴選爭議用相同的方式處理。當時陽明大學校長郭旭崧的資格被國民黨立委質疑，經監察委員和媒體關注後，教育部要求陽明大學遴選委員會委員處理；遴委會一開始是以電子郵件逐一向委員確認，但因許多人表達不同意見，於是再召開一次遴選委員會議，比校方預計上任的去年12月1日，約晚了1個月左右的時間。
至於管中閔是否能在2月1日準時上任？陳焜元表示，2月1日前無法完成上任，就比照郭旭崧的方式，之後由教育部到學校辦校長上任監交。
