國立交通大學2013年5月發表首創單分子基因解碼技術，1個病毒就可判讀基因排序，成本降1/10，時間從1天降為1小時，助疫苗研發跟上病毒變化速度，並將成果發表在國際期刊《自然奈米科技》（Nature Nanotechnology），引起學術界的震撼。但隨之而來的，是美國學界質疑，其實驗的方法與數據都有問題，期刊要求交大進行調查。經過1年的調查，交大校方證實已於7月底將調查結果寄送給期刊，等待期刊對調查結果進行審議。
據指出，交大非常重視Nature Nanotechnology來函要求調查，經過1年召開2次獨立委員會進行審查，並經過黃國華重新進行新技術的實驗，結論是一致，證明這項技術是沒有問題的，已將調查結果寄給Nature Nanotechnology，由該期刊對此調查的結果進行審議。
交通大學材料系教授黃國華和生物科技系助理教授陳昱勳於2013年5月發表研發單分子基因體解碼技術，可加速基因體定序，有助於疫苗和藥物研發。這項新技術就是結合蛋白質電晶體、生物科技以及奈米科技3個領域平台，研發出單分子基因體解碼技術，只要1小時就能完成基因定序，成本可降1/10，只要500美元（約新台幣1萬5000元），且不需添加螢光，判讀準確率也提升。
黃國華將成果發表在國際期刊《自然奈米科技》後，雖然引起學術界與各國大藥廠的震撼與重視，但隨之而來的是研究相同領域的美國學界提出質疑，認為結合蛋白質電晶體實驗的數據有問題，加上電子顯微鏡拍攝基因定序的照片也不尋常，而向Nature Nanotechnology提出質疑，因此該期刊在同年8月在黃國華發表論文電子檔的最後，特別註記了對於各界質疑實驗數據與方式有問題，已去函要求交通大學進行調查。
Nature Nanotechnology在2013年8月在黃國華發表論文網頁的最後，特別註記了對於各界質疑實驗數據效度問題，期刊在進行內部調查後，已去函要求交通大學進行調查。（翻攝自Nature Nanotechnology網站）
經一年重新實驗 教授：經得起考驗與驗證
黃國華接受記者採訪時表示，對於美國學界的質疑，甚至中國方面的攻擊，他雖然氣憤但不以為意，因為2種是完全不同的檢測方式，美國使用的舊式檢測方式較不敏感，常需取樣較多細胞，以人工方式將奈米洞放大，所以耗時成本也高，在用人工方式來突破，一直無法達成。
黃國華強調，他們實驗的方式是採用自然法則，是全新的突破性方法，簡單的說是把基因自然酵素放大，透過結合蛋白質電晶體以及半導體等頂尖技術，只要1個病毒細胞就可進行檢測，且取樣方便，不用擔心病毒不明顯、數量不夠或取不到病毒等狀況；而病毒變化快速，基因定序時間大幅縮短，可幫助疫苗研發跟上病毒變化速度。
黃國華表示，就因為該期刊向學校要求進行調查，因此研究團隊再花1年時間，就這項新技術重新進行實驗，因結果是一致，證明這是沒有問題。雖然他不知道學校調查的結果，但他非常有信心是這項新技術是經得起考驗與驗證。
