為了大潭藻礁公投議題，農委會主委陳吉仲邀環團到農委會開閉門會議，但民進黨副秘書長林飛帆也一同與會。國民黨文傳會副主委黃子哲1日批評，林飛帆現職是民進黨副秘書長，明明是個黨工，卻大搖大擺亂入官署，他譏諷，這是「黨政不分」，還是「黨證加分」？
黃子哲也指出，環團公投案頗讓民進黨焦躁煩心，但其實，該議題的業管機關是經濟部與海委會，與農委會根本無關。黃子哲認為，陳吉仲的介入，是要讓陳吉仲去跟這些環團套套過去的舊交情、甚至是摸頭以化解阻力，但此舉完全是撈過界，不倫不類。
「林飛帆在這場會議的價值就是『收編樣板』的角色」
至於林飛帆，黃子哲稱，林飛帆既非官員，過去也與這些環團並無特別交集，林飛帆在這場會議的價值，其實只有「收編樣板」的角色，可能是代表民進黨高層向環團示意，若願意投靠，可比照他一樣「飛帆騰達」，月領9萬，「若真是如此，那就是極度羞辱這些長期為環保奉獻的公民團體。」
黃子哲稱，如果是像同藻礁公投領銜人潘忠政所說，林飛帆是陳吉仲所邀，是要幫忙轉達環團意見給民進黨，那直接約在民進黨中央黨部與環團溝通即可，何必到農委會？還是林飛帆認為「公家就是我家」？又或是，民進黨重回「以黨領政」的老路，「黨證加分、黨政就不分」，直接把《行政中立法》當塑膠？
黃子哲認為，過去總統府外流的密件也顯示，林飛帆曾樂於配合當蔡英文的打手，面對民進黨執政後背棄過去的理想與價值，林飛帆竟也甘願同流合污，成為共犯結構。「究竟是什麼樣的利益與權力薰心，讓一位覺青竟如此快速的墮落與沉淪？外界很好奇，看不到林飛帆車尾燈的學運老戰友，恐怕更想知道。」
