原訂去年4月完工的南港「國家生技研究園區」，如同台灣生醫產業發展縮影，從規劃到執行一波三折，不僅讓前總統馬英九在卸任前夕，當面指責前中研院長翁啟惠，新政府上台後，蔡英文總統也傳出對「生醫產業創新推動方案」推動緩慢感到不滿，指責科技部，最近在行政院公共工程委員會每周盯進度下，終於可望在年底完工，沒想到，當初規劃進駐的食藥署食品安全實驗室，卻準備在前瞻基礎建設特別預算，另外爭取50億元國家級實驗大樓，讓這個延宕多年的開發方案，又增加一段插曲。
南港生技研究園區 從扁時代起重大投資計畫
南港生技研究園區，是翁啟惠在扁政府時代，爭取到的重大投資計畫，不過，到了馬政府時代，卻陷入了翁啟惠與鴻海董事長郭台銘的角力，2008年8月前閣揆劉兆玄，率財經閣員拜會郭台銘，爭取鴻海在南港202兵工廠興建「數位環保科技城」，然而這個圈地造鎮計畫，卻也引發環保爭議，名作家張曉風在2010年驚天一跪、為南港202兵工廠內的濕地與綠地請命，鴻海投資計畫胎死腹中，「國家生技研究園區」的規劃，又從林口返回南港，為了保存綠地與埤塘，園區面積由原規劃之6.13公頃縮減至3.2公頃。
土地取得、統包規劃都延宕 施工又遭抗議 生醫園區工程多舛
不過，2012年5月行政院正式核定「國家生技研究園區」開發計畫，但實際執行的中研院，因為隸屬總統府，專責工程發包人員較少，加上國防部搬遷過程延宕8個月，原訂2016年4月完工的園區，在2015年12月馬英九視察進度時才發現進度嚴重落後，當場指責翁啟惠，當時正在競選總統的蔡英文，則替中研院說話，批評「總統好像搞錯了方向」，強調工程延宕主因，係國防部土地移交延宕。
綠營執政後，南港生醫園區的工程上緊了發條，考量全案開發金額高達90.1億元，中研院又缺乏專業發包人力，園區基礎構造，又必須開挖部分埤塘，工程困難性很高，行政院因此指定工程會專案協助；而為了做到當初承諾的濕地保育，除了採取統包工程外，部分結構還採取預鑄工法，加快施工進度。由於生醫園區工地，旁邊就是住宅區，施工期間大型機具進出，一度引發居民抗議，工程會還得承擔起與居民溝通責任。
中研院秘書長施明哲表示，南港生醫園區進度落後原因，除了國防部土地移交延宕8個月外，統包商規劃過程也略有延宕，施工期間還發生天候不佳與附近居民抗議情形。
據了解，由於總統蔡英文對於「生醫產業創新推動方案」推動速度落後頗為不滿，包括科技部、經濟部、工程會等相關單位，為了緊盯工程進度，每周還召開專案管理會議，希望園區其中2棟在8月中取得使用執照，另外5棟趕在11月取得使用執照，12月正式竣工啟用。 （相關報導： 風評：食安大樓的問題─只有50億，但也是錢吧！ ｜ 更多文章 ）
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根據行政院在2012年核定版本，「國家生技研究園區」以開發新藥為主要方向，著重於新藥研發與臨床前試驗，因此當初規劃進駐單位，包括科技部實驗動物中心、生物技術開發中心、衛生署食品藥物管理局（TFDA）、台灣生技整合育成中心等機構，園區完成臨床前試驗之藥物，可進一步交由新竹生醫園區等單位進行臨床試驗及後續新藥產製。
