2012年5月，在行政院核定東移之後、南鐵爭議爆發之前，台南市東寧教會曾有過一場介紹南鐵地下化願景的活動。承攬許多公共工程的世曦顧問公司工程師告訴民眾，鐵路地下化對台南唯一的好處是可以節省等待平交道的時間，但台南市完全是賠錢，因此多年來市府都沒有積極推動；會賺錢的則是交通部、台鐵局，因為它們握有大量站區土地。工程師所言與核定版計畫書的內容不謀而合，日前簡凱倫、蔡易廷兩位律師也在投書中詳細說明了此事。
9月5日，台南市都市發展局吳欣修局長投書媒體，聲稱「鐵路地下化是台南市全體市民企盼已久的重要建設，完全符合『公共利益極大化』原則。」至於東移版所能踐行的具體公共利益為何？何謂「貶抑鐵路地下化建設之公共利益」？在破千字的文章裡，吳局長全然不敢提，只顧著把公共利益捧上神壇，試圖哄騙人民喝下一碗成份不明的香灰符水。吳局長叫人民「理性論辯」，市政府卻拼命閃躲可以交叉論辯的聽證；吳局長叫人民「查究事實」，市政府卻從來不敢拿出對己方不利的證據——不管是南鐵案的各版本計畫書，還是日本時代台南漁業協同組合的魚市場土地權利憑證。
公共建設不等於公共利益
公共利益既屬公眾之事，本就該受公評，而非由少數官僚壟斷其詮釋權。公共建設不必然等於公共利益，遍及全台的蚊子館與蚊子園區即是明證，其他看似成功的建設也各自帶來正反不一的影響。例如雪山隧道，在大幅縮短台北－宜蘭車程、帶來便捷交通的同時，卻破壞了當地生態，阻斷了雪山地下水，影響翡翠水庫蓄水量和坪林地區的茶業。在宜蘭被納入雙北一日生活圈後，宜蘭成了台北人的後花園，台北成了宜蘭人的工作地點，而宜蘭房地價格暴漲，農地上也種滿農舍。交通與都市必然相互影響，卻不是每個宜蘭人都喜歡宜蘭如今的樣貌。然而，在隧道興建之前，人民沒有與政府討論政策影響的空間，沒有機會思考這是不是他對家鄉發展的期望，也沒有做好迎接改變的準備。
台南鐵路地下化呢？長久以來，地下化被包裝成最進步的方案，但政府並未以同等的宣傳力道讓人民明白，這是所有立體化、郊區化方案中最昂貴，也最耗能的。1993年省政府出版評估報告時，國債只有現在的七分之一。當年沒有人知道永康會成為台南人口最多的行政區，後來也未因應人口成長修改計畫，將永康納入東移版範圍。在二十年前的規劃者腦中，極端氣候、停用核能、減少碳排放量、遺址保存等觀念很可能根本不存在，但這些卻是二十年後的我們所無法迴避的現實問題。地下化必然可以節省等待平交道的時間，但人民是在清楚知道自己要支付哪些代價的情況下選擇支持的嗎？
核定版計畫書的財務多沿用2007年計算，十年來，原物料、工資皆已上漲，可預期的支出絕對遠高於293.6億。大興土木意味著更多預算被用來建設硬體，其他面臨預算排擠的領域可能是文化藝術、運動、社福、長照或托育。在縣市合併後的大台南，許多市民日常生活中不會經過這九個平交道，卻一樣得面對預算排擠和地價稅、房屋稅等地方稅調漲的結果。 （相關報導： 觀點投書：從擴大專案小組會議看南鐵案的人權困境 ｜ 更多文章 ）
很多人都聽說過鐵路東移是為了讓古蹟台南車站更安全，卻不知道地下化沿線可能潛藏著多處遺址。建築和遺址同為文化資產，命運卻大不相同。在缺乏正確遺址保存觀念的台灣，遺址總為建設犧牲。儘管每一處遺址都是還原台灣史前史的一片拼圖，也是建構本土認同的基礎，但真相是，每一次以「搶救」為名所進行的挖掘，都選擇性地破壞了那些還原史前謎團的線索，更不用說，台灣根本沒有編列足夠的預算以妥善保存、展示那些早已被挖掘出的史前文物。
