年底嘉義縣長選戰，民進黨又出現狀況，嘉義縣副縣長吳芳銘20日下午宣布，不排除以無黨籍參選縣長，他説要為人民爭取權益，給人民另一個選擇，跳脫既有政黨框架，他還說，已將參選決定將告訴縣長張花冠，他是在199l年入黨，他會擇期宣布。
對吳的表態，民進黨發言人何孟樺僅表示，嘉義縣長提名，黨內已經過黨內初選程序，提名候選人，任何黨員有違紀參選等行為，黨中央會快速以黨紀處分。
吳芳銘是洪耀福學弟，吳、洪及翁章梁還曾一起當室友
吳芳銘過去也是許信良前主席幕僚，更是民進黨秘書長洪耀福東海大學政治系，及學運社團大肚山社的學弟，吳早年在洪的拉拔下，到黨中央任職，進入許信良團隊，也擔任過黨務主管，而當年洪耀福會和陳明文接上線，也是曾以研究生身分訪問過張花冠的吳芳銘居中牽線。
吳、洪及民進黨提名的嘉義縣長候選人翁章梁，於幕僚時代，還曾在台北市共同租屋，當過室友過，三人過去交情深厚，對吳的決定，洪僅表示，很久沒跟吳聯絡。
吳芳銘想選，黨內高層：如果堅持要選，那就選吧
不過，一位黨內高層僅表示，吳是張花冠倚重的人馬，今天的說法，連同先前黨職選舉登記，張花冠縣長在沒有黨代表選票情況，也曾想登記參選，挑戰此次黨內各派系協調的默契，都是再向黨中央叫陣，如果吳堅持要選，「那就選吧！」
嘉義縣初選後，鄭文燦曾想找吳芳銘到桃園幫忙
先前嘉義縣黨內初選，黨內有「花文之爭」，張花冠強力反對陳明文力挺的前農委會副主委翁章梁，張一度想力推自己多年重用的吳，但吳因為太久沒繳黨費，重新辦理入黨，黨齡不足，無法參加初選和翁章梁競爭，但翁章梁和議長張明達進行初選，吳也曾公開替張明達助選，翁自己曾透露，地方上遇到吳，似乎是陌生人，對兩人關係演變，熟悉吳、翁多年學運、美系幕僚夥伴情誼的黨內人士，也都頗感慨。 （相關報導： 傳卸任後接101董座 張花冠：我怕冷 ｜ 更多文章 ）
據指出，在翁章梁於黨內初選勝出後，熟悉嘉義縣政情人士也坦言，未來翁的選戰，縣政，不可能會再用吳，黨內也一度傳出，當年也是學運領袖的新系桃園市長鄭文燦，擬借重吳的文才，找吳到桃園市府幫忙，也化解翁和吳的尷尬，這個想法，鄭也曾向陳明文表達，翁營人士表示，鄭確實有表達這想法，但據說張花冠不願放人。
