先前教育部駁回台大校長當選人管中閔聘任，引發政治干涉校園自治爭議，接著開始徹查在對岸掛名師資的各大專院校教師，教育部行文公私立大學，只要參與對岸「國家計劃」，也需報部核定；而後「臺大校長遴選會」傳出委員被北檢約談，且僅電話通知，沒有任何書面憑據；蔡政府推出一系列箝制手段作為因應策略，不只造成兩岸關係嚴重傷害，更使台灣民主發展蒙上一層陰影。
這股綠色恐怖也吹入台灣高中校園，適逢高中畢業季，許多畢業生申請大陸高校蔚為風潮，有許多優秀的高中畢業生捨棄台大而赴大陸名校就學，此西進風潮引發蔡政府的高度關切，甚至傳出有校長遭到教育部與調查局調查是否有鼓勵之嫌，受關注的學校遍及台灣北中南東部，各種形式的關切令校方倍感壓力，綠色恐怖從大專院校中蔓延到中學，但仍難阻擋學子西進的浪潮，蔡政府應當思考究竟該如何提升整體教育水準？以留住青年學子，而非針對校方進行施壓採取不當防堵的方式進行政治干預。
這股教育西進浪潮，不只北部，甚至中南東部學子也躍躍欲試，在學子理性選擇及家長整體考量下，競爭力及未來發展當然是最主要的考量，經濟因素也必不可少，當然國際化更是選擇的主要關鍵，眼看台灣漸漸因為政治內耗而與國際化越離越遠，學子自由選擇國際化、經費充足及就業方便的西進道路，並不令人感到意外。
調查局雖說明澄清本於職權範圍，為了解中共「對台卅一項措施」對我各產業影響程度，由外勤處站派員了解，是依據各項業務職掌依法推動工作，絕非「綠色恐怖」企圖掌控學校。調查局指出，各外勤處站平時即與轄內各機關、學校、企業有常態性公務聯繫，其中包含桃園市武陵高中及台北市建國高中；該局向兩校長了解學生申請赴陸就學情形，純粹是基於業務職掌，全盤了解概況後提供政府施政參考，對於學校治學、行政業務從不干涉，且兩次聯繫純是一般公務聯繫性質，但此舉仍屬不妥，特別是涉及到學生與家長自願選擇意願問題，難免會給外界不良的觀感。
事實上，蔡政府目前採取的防堵措施，既不會解決少子化危機，也不會對學子西進潮產生明顯的阻擋效果，相反地還會產生負面效應，落得政治干預教育及學術自由罵名，也連帶影響兩岸關係發展，更使台灣自由民主蒙羞；施壓校方更是沒有道理，學校怎能左右學子們的自由選擇意願，學校更談不上有鼓勵或倡導的動機。
並且學子們不只會西進，過去一段時間，英、美、港、新、澳等國的大學主動出擊來台招生，各國或地區來台招生目的除了達成國際化多元指標，更重要的是能夠吸引台灣優秀學子前往就讀，對學校未來聲譽也是好事一樁，因此蔡政府又何須將矛頭只針對中國大陸，顯見其意識形態，這難道是善意的表現嗎？
