日本福島核災廢水排放問題，藍營鎖定駐日代表謝長廷攻擊，總統府發言人張惇涵下午臉書發文挺謝長廷，張惇涵強調，謝長廷和原能會的說法，並沒有相互違背。並且，謝長廷和原能會都有向日本政府表達關切，原能會也以書面正式表達反對。謝長廷和原能會的重點也都強調，核電廠排放廢水必須符合國際標準，這是專業問題，應該回歸專業討論，不須政治操作。
張惇涵在文中更說，對於有在野黨或部分人士批評謝長廷是「助日代表」，「我相信，大家都有看到前陣子美日兩國領袖的共同聲明，這是52年來第一次提到台灣，並且強調台海穩定的重要性；根據日本《日經新聞》最新民調，這獲得74%日本民眾的肯定支持。」「因此，在野黨亂貼政治標籤，這對於謝代表，以及第一線辛苦的外交同仁並不公平，完全無助於台日友好關係，也無助於區域和平穩定。」
張惇涵更說，「至於部分在野黨最近不斷炒作召回謝代表返國，或者視訊備詢的議題，我認為，這是兩年之後的事，所以，在野黨挑現在這個時間點，做這些政治操作沒有意義，回歸專業討論才是正辦。」
張惇涵的發文，過去也曾是謝長廷幕僚的民進黨副秘書長林鶴明也按了分享。
張惇涵在文中說，核電廠廢水排放，任何國家都必須依照國際標準、嚴格把關，不是依照意識形態。這陣子，媒體朋友持續關心日本將在兩年後排放核電廠含氚廢水的議題，他向大家報告政府的立場。「首先，無論是任何國家，核電廠的廢水排放，都必須依照國際原子能總署（IAEA）的國際標準和規定來辦理，不是依照藍綠，也不是依照意識形態。」
張惇涵也強調，「原能會在4月24日已經有說明，台灣核電廠的廢水排放，一切符合國際標準，也符合法規規範。」 （相關報導： 獨家》民進黨北市黨部高層兒販毒遭收押 當事人竟神通廣大向北投分局「問罪」 ｜ 更多文章 ）
不過，張惇涵也說，「但由於這與311震災的福島核電廠有關，大家對於新增風險當然有所憂慮。不過，因為這是日本政府兩年之後的規劃，所以，我們要求日方的相關處理措施，必須符合國際原子能總署的國際標準，也必須將完整資訊與台灣共享。我們的的立場是，一定會幫漁民把關、幫國民健康把關、幫海洋環境把關。」
