在核酸檢測中，一開始宣傳為中國負擔所有開支，後來才澄清中國負擔的只是檢測開支，香港需自行負擔採樣、場地、組織、宣傳等開支，費用不菲。光是一次廣告，就用了將近二五○萬港幣。
中國的政治宣傳既針對港人，同樣針對大陸人。九月十二日，內地檢測支援隊在中聯辦安排下接受訪問時，說工作強度大，「連續八小時不用餐」、「穿紙尿布工作」，又強調與港人「同呼吸共命運」等，內地社交媒體又開始用「最美……」稱呼之，都是大陸流行的「正能量」套路。
其次，不少人質疑中國趁此機會大規模收集港人ＤＮＡ。這令人與中國大規模收集新疆維吾爾人ＤＮＡ、建立基因資料庫相類比，擔心香港「新疆化」。由於檢測工作全部由中國公司華大基因公司負責操作，這種擔憂雖然無法證實，但也不無道理。
