中國發行新款卡式台胞證，於21日起全面啟用。陸委會坦承，我方確實未掌握全面啟用的時間點，而中方作法欠缺完善思考及周延配套，也未與我方進行溝通、尊重我方，已傷害台灣民眾的感情。陸委會也強調，中方單方面的作法，不會改變我方依憲法所主張的兩岸關係定位及既定兩岸政策。
繼實施台灣民眾赴中國免簽之後，中方推動卡式台胞證，經1個多月的試行後於21日全面實施。陸委會對此表示，相關訊息中方有關部門在事前已透過雙方既有聯繫管道通知我方，陸委會事先有所掌握，且多次透過既有管道與中方溝通。
針對行政院長毛治國表示未掌握卡式台胞證全面實施的時程，陸委會強調，行政院對於中方作法及兩岸的溝通過程，均有所掌握，「僅是未確認21日為全面啟用卡式證件的時點」。
陸委會同時強調，我政府依據中華民國憲法所主張的兩岸關係定位，以及維持現狀的民意趨勢與政策立場，絕不會因為對岸任何單方作為而有所改變，中方也應積極正視中華民國存在的現實。
陸委會表示，中方此一措施全面擴及所有台灣民眾，導致一般民眾產生中方是否有藉機蒐集個資、指紋等隱私資料或監控個人行蹤等各項疑慮。陸委會認為，中方的作法欠缺完善思考及周延配套，也沒有與我方進行良好的溝通，作法上不尊重我方，傷害台灣民眾的感情，我方已多次表達不滿。
對於卡式證件申辦程序及相關具體執行細節，以及台灣民眾的相關疑慮，陸委會已多次向中方提出，並呼籲中方能夠盡快對外澄清卡式證件唯一用途為旅行證件，以化解外界疑慮。 （相關報導： 卡式台胞證今全面上路 毛治國：看報紙才知道 ｜ 更多文章 ）
陸委會也再次向中方喊話，強調有關兩岸人民往來重大措施之調整，應透過兩岸制度化的聯繫機制，強化事先溝通，以化解不必要的疑慮；未來政府也將繼續關注並了解中方後續的具體執行細節，以保障國人權益。
