中國21日起全面啟用新版卡式台胞證，國台辦雖強調此舉便利兩岸人民往來，但陸委會主委夏立言曾說，中國實施新證，卻是實施前20分鐘才以電話告知陸委會，而台灣部分立委與學者也質疑，新證形同香港「回鄉證」，且新證內建晶片，容易遭到監控。
倉促告知 不尊重台灣
夏立言7月訪美時曾說，兩岸溝通管道雖暢通，但大陸包括執行M503航路及卡式台胞證上的做法，在心態上應多考慮台灣人民感受，做法可更細膩。而夏立言當時說，「好歹商量一下，太不尊重我們了。」
根據《中央社》報導，國立中興大學國際政治研究所教授蔡東杰曾向中央社表示，大陸從經驗發現，在兩岸關係上已難仰賴台灣配合，但兩岸關係又不能止步，這次便捨棄共識，逕自在自己權力範圍內做可以做的事。
卡式台胞證 遭質疑港澳化
新版卡式台胞證，引發台灣部分人士質疑，新證形同「港澳居民來往內地通行證」（回鄉卡）。而陸方僅強調，此舉為兩岸交流交往提供更大便利。
內嵌安全智慧晶片 憂行蹤暴露
由於卡式台胞證內嵌安全智慧晶片，也有部分人士憂心民眾行蹤將更容易被陸方掌握。國立政治大學國際關係研究中心主任丁樹範曾說，卡式台胞證和紙本最大差異就是晶片。一旦民眾使用卡式台胞證，就可能被全球定位，以前還要大陸公安部門調查，現在就可24小時掌握民眾行動。
丁樹範舉例，在大陸買高鐵票需要實名制，卡式台胞證「一刷就完了」。他認為，台灣方面無法透過官方抗議來規避資安風險，但晶片卡引發的國安危機更大。
