八仙塵爆事件，第一時間暴露出各大醫院緊急醫療應變能力的不足，而平時就過勞的醫師面對八仙病患更是分身乏術，醫師工時每週超過100小時是家常便飯，醫師勞動條件改革小組14日呼籲應提出降低工時及合理休息時間方案，挽救醫界「五大皆空」的慘況。
醫師勞動條件改革小組表示，八仙事件已過半個月，200多名病危傷患和塞暴的加護病房讓許多科別的住院醫師疲於奔命，八仙事件首當其衝的就是整形外科，以醫學中心為例，最長工時超過每週100小時是家常便飯，一周只有168小時，相當於一周最多只有68小時休息。
醫勞小組陳秉暉指出，燒燙傷病患需要長時間清創、植皮手術，一個典型的整形外科醫師工作從早上6點半到晚上10點，若病人有突發狀況可能到半夜12點，住院醫師值班過夜可能又要到隔天早晨，在沒有休息狀況下又持續一天的工作，如此下來，住院醫師每週最高工時輕易就超過100小時。
根據衛福部公佈的台灣2015年教學評鑑，每週工時最高88小時，高於美國規定的3小時；醫師延續工時32小時，高於美國的24小時，台灣的評鑑制度也無法保護實習醫師和住院醫師，而衛福部也無法可管，只能透過訪視、訪談住院醫師。由於評鑑監測手段適用範圍過窄，讓衛福部無法完整掌控實際工作狀況，加上醫院欺騙造假，評鑑粉飾太平的狀況層出不窮。
醫改會研究員余天佑批評，衛福部提出的工時報告從去年拖到今年6月，不公布院所別，無法針對醫院進行改革，儘管衛福部公佈住院醫師工時最高時數88小時，但實際狀況是住院醫師留守時，若沒有緊急狀況時的加班只能自行吸收，經常被「凹」工時，余天佑質疑，衛福部不可能不知道這些情況。而行政院的第二預備金是透過醫院來發放，醫師到底有沒有拿到實質的加班薪資不得而知。
台灣勞工陣線秘書長孫友聯質問，勞動部什麼時候才要把醫師納入勞動基準法？現在想用第二預備金解決事情根本是便宜行事，醫療體系不完備讓醫師工時無上限，請勞動部明確回答，在11月12號醫師節前，是否將醫師納入勞動基準法。 （相關報導： 醫療納自經區 醫改團體：健保必受衝擊 ｜ 更多文章 ）
陳秉暉批評，政府只想發第二預備金只想掩蓋事情，醫師沒有時間補休只能忙於工作，根本無法解決問題。最後醫改會要求：教學醫院應檢討評鑑機制，政府該著手讓住院醫師納入勞基法，教學醫院應提出降低工時及休息時間的方案，挽救「五大皆空」的醫療現況。
