高雄市議會國民黨團質疑，高雄巨蛋與大巨蛋同樣未向廠商收取權利金，按北市廉委會標準，應將官員送辦。對此，台北市長柯文哲表示，把所有事情拿出來檢討是好事。而高雄市政府則回應，特偵組早已調查過高雄巨蛋，批評國民黨將兩者混為一談是政治操作。
北市廉委會日前調查遠雄大巨蛋案，認為北市府當時擬定的合約未對遠雄收取權金，涉及明顯圖利，建議北市府將時任台北市長的馬英九、前台北市財政局長李述德移送法務部調查。
對此，高雄市議會國民黨團召開記者會指出，台北大巨蛋，北市府零出資，雖未收取權利金，但有營收2%的回饋計劃；反觀高雄巨蛋，高雄市政府不但提供廠商15億開發協助，又未收取權利金，以此標準，應將時任高雄市長的謝長廷，以及當時的高雄市工務局長林欽榮以「圖利廠商」罪嫌移送。
而柯文哲10日上午被問及此事時表示，現在台灣社會只要說綠的，藍的就反對，說藍的綠的就反對，不過他都沒有意見，認為全部拿出來檢討很好。
高市府則回應，當時高雄巨蛋BOT多次流標，基於特殊投資環境因素，加上財務計劃經當時甄審委員會評估自償率不足，才未訂定權利金收取機制，且《促進民間參與公共建設法》也未規範權利金的計收額度和方式。
高市新聞局長丁允恭也表示，特偵組早已查過大巨蛋，現在國民黨要求市府將前任官員移送司法，根本是「圍魏救趙」幫馬英九解套的政治手段；謝長廷辦公室主任林耀文也指出，台北大巨蛋引起爭議，是因為前後條件變更不夠公開透明，與高雄巨蛋根本不該混為一談。
高雄現代綜合體育館（高雄巨蛋、K-Arena）位於左營區，為一座可容納1萬5000人的多功能體育場，基地面積1萬7000餘坪。由漢威巨蛋（由中鋼和達欣工程合組）以BOT方式興建營運，2008年完工，2009年9月27日正式啟用，由凱格大巨蛋運動公司經營管理。 （相關報導： 大巨蛋案》趙藤雄夜訪市府：增權利金銀行縮手 大巨蛋恐停建 ｜ 更多文章 ）
柯文哲10日也針對大巨蛋爭議表示，他相信不只台北市，將來整個台灣都會跟著改變，會讓BOT或聯開案有比較正面的發展，這是他的主要目的。當然過程當中，不免還是有政治上的問題，「台灣這個社會沒辦法，藍綠分裂嚴重，怎麼做都有聲音，只能盡力。」
