「九合一選舉兩岸台商國民黨後援會」在大陸全國性台商組織「台企聯」主導下成立，主要參與者均為台企聯重量級成員，然而檯面上則以後援總會為名義運作。據透露，主導此事的台企聯一直有意在原本的平台上直接運作，但顧慮台企聯為中國批准的組織，更由前後任中國國台辦主任及海協會長擔任名譽會長，為恐選戰中徒增非議，因此仍決定由台商另行在台成立後援會。
由於擔心國民黨在九合一選舉失利，可能影響2016大選佈局，台企聯提早規劃，在選舉兩個半月前首次為基層選舉成立全國性後援總會。據透露，台企聯會長郭山輝原本希望直接由台企聯出面主導，然而台企聯內部不同意見難以平息，更涉及幾大台商會長的角力，只好另行成立後援總會，由台企聯「榮譽會長」張漢文擔任會長；台灣的具體作業則由張漢文擔任理事長的「中華兩岸台商建研會」執行。
張志軍、陳德銘都是台企聯名譽會長
據了解，台企聯儘管並不避諱挺藍立場，但國民黨卻有另一層顧慮。由於台企聯為中國官方正式批准成立的民間組織，會內設有三個「名譽會長」，分別由中國國台辦主任及海協會會長出任，現任者為張志軍、陳德銘及陳雲林；另有一名總顧問，由國台辦副主任鄭立中擔任，雖然都不涉及會務，但仍可能在選戰中引起對手攻擊。
大陸台商有組織地參與台灣選舉，最早為2004年力挺連宋配。當時不僅各地台協會長聯名刊登平面廣告，更返台舉行大型造勢活動。國民黨爭取執政權失利後，大陸各地台協經過3年整合，於2007年4月成立「台企聯」，並在2008年及2012年全國選舉均扮演重要角色。
以商圍政北京2005年同意台企聯成立
在爭取台企聯成立當時，由於中國對「全國性」組織有所顧忌，因此遲遲不願同意。在2005年連、宋二人先後赴中國訪問後，因民進黨執政而中斷的兩岸交流轉為政黨交流；北京也在以商圍政的考量下，同意台企聯的成立，更在其後成為兩岸間政商往來的重要平台之一。
據參與重量級台商透露，在台企聯成立不久之後，原有意在台灣設立辦事處，平時做為服務及聯繫的窗口，選舉期間便可兼顧動員台商、參與造勢等工作。然而辦事處一直未獲兩岸官方首肯，如今到了選戰動員時刻，也只能另起爐灶，另行成立後援組織。
