前陸委會副主委張顯耀案，傳出調查局要求高檢署朝「外患罪」偵辦。台聯主席黃昆輝21日表示，高檢署應先偵辦總統馬英九的外患罪案，不要把司法拿來做政治鬥爭工具。
黃昆輝於2011年10月27日對馬英九及前國安會秘書長蘇起2人提出涉嫌外患罪及偽造文書罪之告訴，理由是2人附和中華人民共和國「一個中國」原則，對我國係屬滅國主張，而「九二共識」更是與中華人民共和國同謀，使台灣屬於中華人民共和國領域之叛國行為，全案於2013年10月列為他字案結案。
2013年11月29日，黃昆輝又再以「默許中華人民共和國將防空識別區納入釣魚台列嶼，侵犯我國領空，馬英九所領導之中華民國政府交通部還任由台灣航空公司向中國遞交飛行計畫書，形同承認中國之防空識別區」，再次向高檢署提出叛國之補充理由，高檢署當時表示將會分案處理，但台聯表示高檢署毫無作為。
針對調查局要求高檢署偵辦張顯耀「外患罪」，黃昆輝要求高檢署應先辦「大尾的」，馬英九總統是史上第一位被提告外患罪的總統，高檢署至今卻還沒動靜。黃昆輝表示，他不了解張顯耀涉及外患罪的事證為何，但是馬英九涉及觸犯外患罪叛國可是罪證確鑿，在全國老百姓面前，高檢署卻都不敢辦，他認為高檢署至少應該趕快啟動對馬英九的偵辦程序，不能吃案。
