我一壁收購及細讀新史料，一壁開始撰著工作。我早已訂定計畫作縱橫研究。所謂縱者，即將所得獲及可靠的史蹟，化零為整，沿直線，依年期，一一寫出來，由洪秀全出生之時起，以至太平軍全部消滅止。其間，最初一時期，由醞釀革命以至攻克南京，史蹟簡單，全軍只走一條路線，故用編年體。以後，分兵北伐、西征，同時在各省作戰，史蹟複雜，則用紀事本末體，分題敘述。至太平與清方兩面的領袖人物則用紀傳體表出其出身、家世等。如此運用吾國治史的三方法至為適當。至於橫的研究，則是將全部太平史料作橫剖，分題歸納其真蹟，以表出太平建國各種制度、文物真相，各作系統的說明。以上雙管齊下的縱橫研究，凡立言均有出處根據，乃成為客觀的科學的歷史。所有的主觀成分只在於晦澀難明之處，加以解釋，而仍本於個人的知識與見解，從不敢虛構一言一事也。事蹟出處及個人論據，一一註明於每事或每句之後，時或有詳細註釋在每事之後，輒有子注長於正文者。此我個人之方法與中外著者異。
我除了根據研究的總結論，堅信太平革命為民族革命這一大原則絕無妥協之餘地外，關於雙方敵對者之人物、政策、兵略、措施，與其他一切事為，其臧否、優劣、是非，從無偏見私見，一是本著事實與文獻，好者說好，絕不誇張，歹者說歹，絕不隱諱。例如：對於洪氏之揭櫫民族大義領導革命，忠於國族，至死不渝，我之讚頌，無以復加。然而對於他昏庸迷信之種種短處，卒致大業失敗，我亦盡情暴露，他人評述，罕有其匹者。至對於曾國藩之好名、殘酷、反對革命，我之貶辭世所鮮見，但對於他的文才、毅力、知人、用兵等種種優點，我亦據事直書，他人無如此稱許的譽辭。（看《全史》中冊頁一一五二）關於雙方其他的人物及事蹟均如此立言，態度獨立，自信史筆公平正直，無媿於科學的史學。
我開始寫作，首從《太平天國全史》下筆。未撰全文之前，先用大塊紙張編一本「太平天國大事年月日表」。上格橫書年月日，第二格為清廷大事，下格乃為太平大事，由洪秀全出生始，以至奠都天京，原係全軍共由單線行動。迨分兵北伐西征，則其下又分兩格，按時日簡略寫出大事。以後戰事蔓延，則又分多格，每一戰區或一種大活動自為一格，以至全局軍事結束為止。如是全部史事繫於時日之下，自有整個系統的繼續性，不再凌亂無序。「大事表」成，全部歷史乃有綱領。以後可按此綱領，分題細述始末。這是我創作的新方法，甚為合用。（此表迄未發表）。
表成，我乃從事撰寫全史稿，先將舊著《首義史》卷二至卷七，及昔時在《大風》，及在重慶發表各篇，全行修正重寫，得十一章。繼又續撰十八章。共成二十九章，全稿殺青。這個革命大運動之全部史蹟，擧凡前人之所誤解或未明者，皆一一糾正，下新斷論，詳細說明，有活動的真相，兼有簇新的系統，更有連串一貫性的歷史活現出來。計我於此書稿閉戶埋頭專心苦幹者共歷三年。 （相關報導： 王宗偉觀點：改變中國歷史命運的228事件 ｜ 更多文章 ）
一九五三年春，香港大學創設「東方文化研究院」。我膺任研究員之一，以「太平天國」為我個人的研究對象。這席位正符合我的工作，所以樂於擔任。先將《全史》稿——即縱的研究部分擱置起來，而從事作橫的研究，即是將這大運動之生活真相，作橫面解剖，分別研究其典章、制度，與一切文物、理想，分題表出各方面活動與創作的成果，如政治（包括各級政府、爵號、禮儀、璽印、外交等），經濟（包括食貨、賦稅、商務、田政、泉幣等），文化（包括宮室、科擧、文學、曆法等），社會（包括婦女、婚姻、禁革惡風陋習等），軍事（包括軍制、軍規、軍紀等）及宗教（包括倫理、道德等）。
