才下水不到3年的海研五號海洋研究船，在雙十國慶日傍晚偏離航道，於澎湖外海觸礁沉沒，造成2名研究人員罹難、25人輕重傷的悲劇，除了造成國家級的研究計劃延宕，更糟糕的是，該研究船是國內唯一可進行飛彈觀測的科學船，雖然參與2013年底雲峰中程飛彈的1200公里實彈測試，但隨著該船觸礁沉沒，軍方精心規劃完全泡湯，中科院多項飛彈的測試都因而延後期程。
據指出，國防部編列23億8700多萬元進行代號「星隼專案」，延長九鵬基地遠距離飛彈觀測系統，該專案除了更新蘭嶼、綠島的追蹤設備之外，最主要的是讓海研五號研究船具有追蹤觀測並分析飛彈飛行數據的能力，使該船除了能夠探勘海底世界外，更增添掌握空中飛行目標的能力，成為國內唯一的飛彈觀測船。
知情人士指出，海研五號船上科學設備都採模組化，中科院在船上的科研裝備上預留空間，執行任務時才裝上相列雷達、追蹤用的X-band雷達以及計算飛行數據的設備，船的外觀也才會多出兩個橢圓形雷達罩，任務結束後，中科院人員會在第一時間將各項裝備拆離研究船，因此外界極難發現該船的特殊任務。
該名人士指出，海研五號研究船參與飛彈觀測追蹤的任務不會超過5次，但最重要的是在2013年底雲峰中程飛彈的1200公里實彈測試，海研五號研究船成功的追蹤並記錄到雲峰飛彈在太平洋上空的軌跡，也證明了該船在遠距離飛彈觀測的實用性。
據瞭解，中科院量產雲峰中程飛彈雖被迫喊停，但增程型「雄三」超音速反艦飛彈以及天弓三型防空飛彈的遠距離實彈測試都需要飛彈觀測船，但因海研五號觸礁沉沒，工作母船的消失也讓裝置在船上的相列雷達，以及追蹤用的X-band雷達相關設備，只能靜悄悄的躺在中科院的研發單位中，不知何時才能再裝上船追蹤飛彈。
