「2016台北馬拉松」18日清晨開跑，台北市長柯文哲在市政府前廣場為全程馬拉松起跑鳴槍，並到北門（承恩門）為跑者加油。柯文哲於致詞時表示，此次比賽共有2萬5000人熱鬧響應，希望大家能在馬拉松的比賽過程中感受美麗且熱情的台北市，並歡迎來自國際、外縣市的朋友們，與台北市民一起參與台北馬拉松。
最後成績揭曉，由肯亞選手基特瓦拉（Sammy Kitwara）以2小時9分59秒獲得全馬男子冠軍，打破大會紀錄，帶走180萬元獎金。全馬女子冠軍由也是肯亞選手的奇巴魯斯（Mercy Jerotich Kibarus）獲得，成績2小時36分33秒。
全馬表現最佳的台灣男女選手為蔣介文，以2小時20分59秒獲得男子總排名第6；謝千鶴則以2小時43分25秒，在女子總排名中獲得第5。
中華民國路跑協會秘書長陳華恒表示，今年比賽路線改變，以「古城巡禮」為主題，河濱賽道較以往少了6公里，因此選手跑起來也減少風的阻力，今天溫度比往年高，但濕度較低，整體素質都有提升。
台北馬拉松今年舉辦第30周年，共有40個國家，約2千名外國跑者參與。今年馬拉松賽道將會經過北門、南門、小南門、東門，也就是台北古城的承恩門、麗正門、重熙門與景福門等4座城門，希望能讓跑者體驗台北城市的多元面向及歷史。
今年的台北馬拉松也有來自上海、因雙城論壇簽署體育交流備忘錄而來的馬拉松隊伍，為台北及上海第一次在馬拉松上的交流。對此，柯文哲表示，本屆台北馬拉松不僅是體育上的交流，也是城市觀光上的交流。至於日後與上海會不會繼續交流，柯文哲表示，若沒有意外的話，互相交流並非壞事。
