國防大學2012年經學生年度體檢報告，得知男大生阿立（化名）罹患愛滋病，除禁止他參加游泳考試外，更要求獨立清洗個人衣物及餐盤，最終校方以「私帶電腦入營、資安稽查時態度不佳」為由，連續記過並勒令退學。衛福部疾管署已決定依法向歧視愛滋病患的校方開罰100萬元，寫下歷年歧視愛滋病患開罰金額最高紀錄。
男大生阿立因感染愛滋在畢業前夕遭國防大學退學，疾管署認定校方歧視事實明確，要求校方3個月內予以復學或和解。國防大學不服，認為《人類免疫缺乏病毒傳染防治及感染者權益保障條例》並未明定衛福部對於感染者權益保障有最終決定權，也未界定命其改善的範圍，因此一狀告上法院要求撤銷行政處分。
全案纏訟2年，台北高等行政法院認為阿立若不服退學處分，應在30天內向學校申評會申訴，但由於已逾期提出，退學處分已確定，加上國防大學主管機關為國防部，衛福部無權撤銷退學處分，今年4月判決衛福部敗訴。
疾管署副署長周志浩指出，衛福部雖敗訴，但判決書中也強調，衛福部得以依《感染者權益保障條例》，依法裁處罰鍰，並要求限期改善，若校方未與阿立取得和解共識，如恢復阿立的就學權等，該署可連續處罰。疾管署表示，目前行政處分書已簽報至衛福部，待部長林奏延簽准即可開罰。 （相關報導： 愛滋男大生遭退學，疾管署將三度遞狀陳情 ｜ 更多文章 ）
疾管署表示，今年5月已正式提起上訴，3度遞狀法院要求正視歧視問題。聯合國愛滋病組織（UNAIDS）7月更致函疾管署關切，除肯定台灣消除歧視的努力，並重申保障愛滋病患就學免於歧視的基本人權，最後提供美國、印度、肯亞、斯里蘭卡等國關於愛滋病患就學權的判決，供疾管署參考。
