前陣子因學生校園性侵、教師處理不當而頻頻躍上新聞版面的天主教輔仁大學，5日又因校牧室對全校發出公開信，信中分析同性戀是基督教聖經不允許的行為，且無論天生或後天，因為無法繁衍後代，就跟竊盜、說謊、抽菸等行為一樣，本質上是錯的、不該合理化，此說一出，立即引發反彈與爭議。
第14屆同志大遊行剛結束，多個地方政府也掛起彩虹旗，支持多元立場。輔大校牧室表示，台灣地區主教團祕書長陳科神父代表主教團於3日舉行記者會，公開發表台灣天主教對立法院推動的同性婚姻法嚴正的反對立場，「這也是全世界天主教的看法」，前輔仁聖博敏神學院的院長曾慶導神父也於近日發表專文，詳細剖析，因此要將此文與全校分享。
輔大校牧室信中提到，「婚姻不是基本人權」、「同志運動的目的是以反歧視之名，有計畫、有步驟地鼓吹全面性解放……對人類的婚姻、家庭有多麼深遠的危害」、「真正天生有同性戀傾向的人只占同性戀者的極少數」、「繁衍後代都是人類性行為的主要目的」、「同性戀性行為的本質是錯的，違反了性行為本質上所應具有的對生命開放的目的」、「同性戀者的結合不能被稱為『婚姻』」等。
曾以同志身分參選台南立委的台南市新芽協會秘書長楊智達，公開在臉書發文批評，「有夠離譜！天主教輔仁大學校牧室公然透過學術系統電子郵件對全校師生傳教、鼓吹基督信仰教義當中的單一家庭價值，學術機構辯證真理的倫理與多元價值何在？放任夏夕夏景的異性戀情慾流動，卻對同性戀指指點點，性道德標準何在？」
有輔大校友在臉書上表示「為校方感到羞恥」，也有校友表示，輔大校方又再一次歧視同志，信中內容充滿錯誤偏見，公開且理直氣壯地歧視同志，無視輔大同性戀校友的感受，讓人無法理解。也有網友留言「輔大的神父修女都不生育，會造成人類滅絕啊！」、「好丟臉！我絕對不說我畢業於輔大！」、「完全看不下去，輔大不配辦學校！」 （相關報導： 同性婚問題多？婦團：台灣少子化沒條件、教團：異性婚是天父的禮物… ｜ 更多文章 ）
輔大校方對此解釋，校牧室是宗教體系，和學校機關本身是屬於不同的體系。
